mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCGGTTTTTGCC CAAAAAACACAATTACTTTTGT TCTATTAAATGTAACTATTGGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGTTTTTGCCATTACTTTCAATGACAAAAAACACAATTACTTTTGTACCAACCTAATAGTAGTGTGCTAGAA TTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACTTCATATCTATTCAATTCTATTAAATGTAACTATTGGGTTGGTGCAAAAGTAATTGCGGTTTTTGCCATTACTTTCAATGACAAAAAACACAATTACTTTTGTACCAACCTAATAGTAGTGTGCTAGAAAATGTTTCCTGGGGTGGTGGGCAGGTTTGCCAATTTCTATAGTGTAAATACTCCTATCATGGCCAATTTCAAGCTACCAGCAGTGAACACAGGGTTGAGAAGAGATAAAGACAATTATCATAATCTTGTGTGAGACAGTTCCAGCGTGCCACTAAATTTAATTCATCATTCTTAGCCAGAAGTTTCCATCACAGACTCTAAAAACATATTTTGAAAATAATATTTCCCAATCCACACCCAAGATTCTGATGTAGGAGATATAGACTGGGATCTCGGTATTTGCATATTTTTAGCAATCCCCAGGTAGTTCTGAGGTACATGTTCAGAAAAAAAACACTTTTGGCTGCCACTAATCTGTCAATACTCTTTGGTTATAAGTTGTTCAATCAGCTCCAAATCCTCCTAACTATATTATCATTCATCTCGTATATTTTGGTCCTCCACAAGAACAGCATGACAGGTTTTANAAAACAGTCTTCTTAAATTTTATGCCTATGACATTCTCCTATTCAATTAAGAGAACTAACTTCNAAAGAAAATTA 3 1 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 2e-27 hsa-mir-548h-2 1e-25 -45 ((((.((.((...(((((((((((((((((((((((((((..((((((..((((......))))...)))))).))))))))))))))))))))))))))).)).)).)))). (-45)