mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGTGGTTTTTTG AAAACCACAATTACTGTTGC GACATGGCAGTGACTAATATTAGGTTGGTACAAAAGTAATTGTGGTTTTTTGCCATTGAAAGTAATGGTGAAAACCACAATTACTGTTGCAACAACCTAATATAAAGGATCAAATGCG TGGCCCGGGATTTANGGCATTGTTTTCTCCAATTTATTCACTTAGTTACAAATATTTATTGATATATCAGGCATTGTTCTAGACACTAGGGTTAAATCCATGAGTAAAAATATAGAAATTAACATCTTCGTGAGGGACATGGCAGTGACTAATATTAGGTTGGTACAAAAGTAATTGTGGTTTTTTGCCATTGAAAGTAATGGTGAAAACCACAATTACTGTTGCAACAACCTAATATAAAGGATCAAATGCGTTATATTAGGTGGTTAGAAAGCACTAAGGTTAAAAACTAAGCAGGAAAGTGGTAAAGAATGCTAGGAGATGAGA 2 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 8e-18 hsa-mir-548aa-2 3e-20 -45.9 ......(((.(((((.(((((((((((...(((.((((((((((((((((.(((((((....))))))))))))))))))))))).)))...)))))))))))...)).)))..))). (-45.9)