mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAAAGTAATTGTGGTTTTGC AAAGCTGCATTTACTTTTGCA ACTAAAACTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGTTTTGCCATTATTTTCAAAGCTGCATTTACTTTTGCACAAACCTGATATATGATA TTATGATCATAAGTTTCCTATGATCCCAGCAATGACCCATGACTAAAGTTATGGGGATGACCATTCCCAGTAGCTACCAAAAAAACCCATAAATTCCATAAGAAGAAAATTAACAAGTTTATAAGATCTATATAGAAAAAATAAATAAAAGTAAGAAAGCCTTGCTATAGAATATAAAGGGAAATGTGAATAGATAGAAACATTAACATGTTCCTGAATGGGAACACTCAATACTATAAAGGTGATAAAAGAAGGTTCCCAAGGGGAGCCGTATGTGCCATATATTGGAACATATTATAAAGCTACAGAAACTAAAACTATTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGTTTTGCCATTATTTTCAAAGCTGCATTTACTTTTGCACAAACCTGATATATGATATAGGCATACCATATACCAACGTTATAATGCAGAATTCTGAAACAGACTCCTTTATAAAGGAAAGTTAAGTTTGATAAAGGGGGAATGATAAGTAAGTGGGGAGAGGAGAGGCTTCCATTGTATTGAGACCACACTGAAGATCCCTTTAAAAATATAAAATATATAAATGTCTAATGGATTAAAGACTCTAACAGAGAAAACAGTCTGTAAAAATGCTAGAAAAAAGTATCTTGGGCTGGATGCATGGTCACACCTGTAATTCCAGCACTTTGGAGGCAGATGGGAGGATTGTTGAGCCAGCAGTCAAGACAGCTGGGAAACCATCTGGAAAAGCTAAAATAGTGGCATGGAGGATGCCAGTCCGCTATAGAGCGAGAGAGCACTGACCAAGCAGGGGGGGGACGCCACGCCACTGAGAAGGGCCGTCAAAAAGGGGTGAAACCCGGCACAAGCCGTTGAAGCAAAAGAAACAGGGCCGAAAGGCACAACCGGTGCACCCCAAATATGTACACACAGACTCAACCGGACAC 2 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.00000000002 hsa-mir-548aa-1 0.00000000002 -35.6 ........(((((((((.((((((((((((.((((((((((..........)))))))))).)))))))))))).)))))))))....... (-35.6)