mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCTGC AGAGCTTAGCTGATTGGTGAACA GATGACCTCTCTAACAAGGTGCAGAGCTTAGCTGATTGGTGAACAGTGATTGGTTTCCGCTTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGCACCTGAAGAGAAGGTGAGA CCCCCCCTCACCNCATCGCNATCCCCGGGACCCCCCCGCCCACTATTGCTGGTACGGTCCGGAATTCATACGATCTCGCGAAACCGTGGTCGCGCTTTCTGCAGATTGGAGAACAGGTGCATCTCGTAGCTCTTCTTTGGAAACAAAAGAAGCCACCAGCTGAGGAAGATGCTCACCGGTCACCGCCCCTTTATTTATGCCCAGCGATGACCTCTCTAACAAGGTGCAGAGCTTAGCTGATTGGTGAACAGTGATTGGTTTCCGCTTTGTTCACAGTGGCTAAGTTCTGCACCTGAAGAGAAGGTGAGATGGGGACAGTTAAGTTGGAGCCGCTGGGGCAGAGGCCGTTGCTGACGGGCCGGCCGCTGCTGCACAGTCAGCTTGGGTGCGGAGCGCGATCCTGGAGGATGAGAGACCACTTGACCCCAAGGATGCACTGTCTCCTGCTGGGAATGCTAGCCATGTACTGAGTCCTTAACTCTGTCCACAGAAACATCCACTAATCGGACATCTGTCTGAAAGGTCAAATGTATTGAAAGTTGCAAAAATTCTTCTTACAAAAAACTAAAACCAAATGCATCACCTAAGTCGTGTGAAATCATGTGGTAGCTCATGGCTGTGAGCGGGGCGGGGCGGGGCTTTCGGAGGAGCTCCTGTTGTTCTGGGCGCGGCTGAACTCTCTCTTGTATTTGCAGTGCAGGGCTTCGCGCCTCCTGCGCCCGCCAGACGGTGCCCACAGGAGCTCCCAAGCTGAAGGCGCTGCTTTATCCGGGCCTGCCCGATTGGGACCTCTGCCCCCCCCGGAGCCCCACCCGAATGTGGCCACTGACGATCCCCCAAAGGCCACCCGCGCGCGGATCTTGCCCCGCTGCCCATACCGGGTCTACAACGGTCTGGCCGTTTCACCCCCCTTTCTTCAACCCCACTCCTACTCCCCCCATGCTCCCCATCGTTTGGCGACACATACGATATAATTACCCCCACCCCCCCCCCTTTCCCATCTCACCATCACCCCCGTCGCTGGCCGTGATGCCAGCCCGCGATGCCCCACCCCCCTGGCCCCAAAATAACACCAGAGTATGCCCGATCAAACCTGACCTCCCCGCCTTGGTCCGTCCCCCCCCTTTTTATGCACCCGGCGCCCTAGAAAATAAACCACCTCCGGTGGAAGCCCCTCACTCCCTCCAAAACCCCACCCCATTGCACCTATACATCTACTCCACTCCCGCGTGATGGGGCCGACTAACCCTGTTTTTCGCCCCCACCATTGTCGCCCCACCACCCCCCGCCACGGTTTTTCCCGAGATTTGGCACTGCAACTCCAATTTGGCCCC 2 2 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-27 5e-28 mml-mir-27b 3e-50 -48.3 ....((((((((....((((((((((((((((((....((((((((....(((...)))..))))))))..))))))))))))))))))..)))).)))).... (-48.3)