mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCTACCATTGCCTACATTAT AATGGGTGGAGGTCGAGCC GTCTCACTCTTCTGAATCCGGAAATGGGTGGAGGTCGAGCCCCGTTAAATCGAGGTTACAGTTTGCAGAAAATTCTTCCTGACTCTATAACCAAAGTGTACAAAGTAACAGATTTTTGGCGCGTGAATTTTAGACTTGCAGCACTGTTCATTACGGACCTGTTATCTGCATATGCAATATATGTGATGATGAACTATTTAACAAATGTCTGGAATTTAAGCATTACACGGGGTGCTGCTATCATAAACATTTGGGATGGAATCACATCGGCTTTGGTCATTGTGCTTGCCTTTTTTGTTGATGCCTTCTTGGATGCCTTCTATATGGTTGTACTCTCTACCATTGCCTACATTATCGGATTTGGATTATTGTCC ATCAGAAACTCAACTTTTCATTTTTAAGTCTCACTCTTCTGAATCCGGAAATGGGTGGAGGTCGAGCCCCGTTAAATCGAGGTTACAGTTTGCAGAAAATTCTTCCTGACTCTATAACCAAAGTGTACAAAGTAACAGATTTTTGGCGCGTGAATTTTAGACTTGCAGCACTGTTCATTACGGACCTGTTATCTGCATATGCAATATATGTGATGATGAACTATTTAACAAATGTCTGGAATTTAAGCATTACACGGGGTGCTGCTATCATAAACATTTGGGATGGAATCACATCGGCTTTGGTCATTGTGCTTGCCTTTTTTGTTGATGCCTTCTTGGATGCCTTCTATATGGTTGTACTCTCTACCATTGCCTACATTATCGGATTTGGATTATTGTCCTTGTCAACGCCAACCTTCTTTGGTCCATGTAGCCACTACAAGGAGGAATGTATCGGCCACAAACAAAAAGTCCTTTTTTTTACTGCCTTACCATTCATAGCAATCGGAGTAGCTGGTCGAGTCTCATTATATTCCTTTGATGAACAACAAGCTGAAGCTCGAGCTGAAGCTAAAGCTCGAGCTGAAGCTAAAGCTCAAGCTGTAGCTGCAACTCCAACTGCAGCTCCAGCTGTACCTGTAGCTGAAGCACAATCTCAAAGTCAAGCTGATCAAGAGGAAGTCGGAATGGCCGGTTCCCTTATCTCTCGATTGTCCTCAATATCTCTACAAGCTGATCAAGAGGAAGTACAAA 4 2 3' arm Guizotia_abyssinica mirnest 100 100 -83.9 ..........(((((((((((.(((((((((.(((.(((((((((.(((((..(((((.((....(((.((....)).)))...)).)))))...((..........)).))))).(((.((.((((((((((((..........((((((((.(((.......)))(((((((...)))))))..))))))))............)))))))))))).)).))).)))))))..(((.((((((..(((((((((.((.((((((..(((...(((......))).))).....)).)))).)).))))))))).......)))))).)))...)).))).))))))..))).)))))))))))......... (-83.9)