mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGCACCACACAGGCCGGGC TGGTCTGCGTGGTGCTCGGG CCCGGGACCTTGGTCCAGGCGCTGGTCTGCGTGGTGCTCGGGTGGATAAGTCTGATCTGAGCACCACACAGGCCGGGCGCCGGGACCAAGGGGGCTC ACTGCCTCCCCGGGACACAGCAGTCATGGCTTCGACTGTGACTTCTTAACTGGCTCCTCCCTGATCGCTGAGCTAAGCCACAGGAGAAGGGGAGGAGGGCTTCCTTCCCGGGACCTTGGTCCAGGCGCTGGTCTGCGTGGTGCTCGGGTGGATAAGTCTGATCTGAGCACCACACAGGCCGGGCGCCGGGACCAAGGGGGCTCGACAAGAGGATCTCAGAACAAGCTGAGTCTCTGGAACTAGCTGGGGTGCGTGGAAGTACGCGCCACGGCCCGCGATTCCTGGGAGCGTGTCTCAACTTCTGCCAGTGCCAACGCAGGAGAGAGAATTGCGGCTCAGAGAGGGTAGCGTGAATGGAAACCGAAGGGCGAGAGCTTGGCTCTCTAATGCCACCCAACTTAGTGGTTCAGAGCTTGGCCTCCAAGGAAGATTCAGTTCAAGTCCCCGCTCTCCAACTTACCAGCTGTGTGATCTTGGGGGAAGTTAACCTCTCTGAGTCTGTTTCCTGCTCTGTAAAATGGAAATTTAAAAACTTAAACATCTACTTCTGTCGAGGCTGTTGTGAAGAAG 1 1 3' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-3663 3e-50 -60.8 ...(((.(((((((((.((((((((((((.((((((((((((((((....))).))))))))))))).)))))).)))))).)))))))))...))) (-60.8)