mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCACTTGGATCTGAAGGCTGC AGCCTTCAGATCTTGGTGTTT GTCTTGGGCCACTTGGATCTGAAGGCTGCCCCTTTGCTCTCTGGGGTAGCCTTCAGATCTTGGTGTTTTGAAT GTCTTGGGCCACTTGGATCTGAAGGCTGCCCCTTTGCTCTCTGGGGTAGCCTTCAGATCTTGGTGTTTTGAATTCTTACTATAGATGTTTTTAAAGTTCCAAAGTCATTGAGTTTCAATGTTACATAAACTCCATTACCCGCATGTTGGGGCTTGATCTCCTGGTTATTATCTGTGCTTGAGGAAACACCCACAGCAGTCTCTACCCAGAACAGTTTCCTAAAGAGGCATACCCTCTTCCTCCACTGGAAAATAGTGCGTTCCCTTCCTACCCTGCACACCCATCGCCCCCACATTGATGGTTTTCAAACAGCAAACTTTTCAGCTAAAGCTTCAAACCATGATTGGAATCAGCCTGTGTTGGATTTGTGATTCAGGGTCATGGTGACCCTGATCCAGTTTGGGTGGAAATCCTTCCTAAGTATCATAAGAAGCATCTTGGCAGAGATGCTTTGGTGGCAGCCATGAGCTTTGCTGGAGGCCTTGCTTCCCATAGCCTTGGCTGTGGGGCAAGGAACTCTGCCAGGCGAGGGGGATGCTGCCCTGGATCAACAGAAGCCTGGTGGGTTTGCTCGTGTTAGAGTGTCCTGCCTTCTTACTGACAACTCTTCTCGGTGATAGCCTCTCTTCCCTGGATTGTGACATATGGAATGACAGTGCANGTACCACCCGAGCTAGCACAGTCAAGCCTCCAGCTAAGCTGGATCCCTGAAGCCTGCTATCATGCAGACAGGCTATGCGGCTGCCTCGGACCATGCTAGGCCACTTGGCTGGGGTGTCCACCTACCACCAAAGGGGTCTTTTAGCAAACCTCATGGGGGACAGGAAACATCCTGTTCATCCCTGGGCACANGCTGCAGACCCAGCACTGGCCCTTTGCTGGAGTCAGAAGCCTGGGGGCTGCGCCTAACCCCCTTCTAT 2 0 5' arm Homo_sapiens mirnest 100 hsa-mir-3614 5e-36 -38.5 ...(((((.((((.((((((((((((((((((..........)))))))))))))))))).)))).))))).. (-38.5)