mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCAGGCAACAAAGTGAGACT GATTGCTTGAGCCTGGGAG TTCAAGACCAGCCCAGGCAACAAAGTGAGACTCCTTCTCTGTAAAAAAATTAAAAATTAGCCAGGTGTGATGGCATGCCCCTGTAGTCACAGCTGCTTGGTAAGGTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCTGGGAGGCTGAGAT CACGGTGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCCCTTTGAGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAAGATGGTGAAACCCGGTCTCTAGTAAAAATACAAAAGTTAGCTGGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGCAATCCTAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGAGAACTGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGGGCTGAGATCGCACCACTGCACTTCAACCTGGGAGACAAACCGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAATGTACAAACCAAAAAGGAAAAATACCATCAACCCAACAGAAAAATGTGGATGTGGACAACTGGAAACAGAAAAGACGAGACCCATCATGGTGGCTCACATCTGTAATTCCAGTATTTTCAGAGGCTGAGGTAGGAGAATTGCTTGAAGCCAGGAGTTCAAGACCAGCCCAGGCAACAAAGTGAGACTCCTTCTCTGTAAAAAAATTAAAAATTAGCCAGGTGTGATGGCATGCCCCTGTAGTCACAGCTGCTTGGTAAGGTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCTGGGAGGCTGAGATTGCAGTGAGCTGTGATCATGCCACTGCACTGCAGCCTGGGTGACTAAAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAATAGAATAAAAAGACTTAACATTTCTATAAAAATGTCAATGTAGGCCAGGCGCGGTGGCTCACACCTGTA 4 2 5' arm Homo_sapiens mirnest Metazoa_SRP 0.00000000003 hsa-mir-1273f 0.000000007 -42.8 ((((.(.((..(((((((....((((((..(((((.(((.................((.((((((((((((.(((......))).)))))....))))))).))..)))..)))))..))))))..))))))).))))))).. (-42.8)