mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCGGTTTTTGC ACGAGACAACTACTTTGAA TATCTTAAACCAGCTTTGAGGCACGAGACAACTACTTTGAAAACCTTTATTATAGGTGAATGCAAAAGTAATTGCGGTTTTTGCACTGTTGGAATTTGCCATT TTATAATCTGTTTGCTTGAATGAATCAGTTTCATGCTAGACGTCTTGAATATTTTCAGAGAAACATTTTAAATCTGTAGTTTCAAATATAATGTTGATTTTCTCTGTATCAACTGTATAAAAGTGCAGTACAGAACATTTGACTTCATTACAATATCTTAAACCAGCTTTGAGGCACGAGACAACTACTTTGAAAACCTTTATTATAGGTGAATGCAAAAGTAATTGCGGTTTTTGCACTGTTGGAATTTGCCATTTGATATTGGTATACATTCTTAAATAAATGTGGTTATGTTATATATCATTTTAATGCGCATTTCTCGCTTTATGCGTTTTTGCTAATGACTTATTACTTGCTGTTTATGTTTATTTTAGACTATGGAAATGATGTCAGACAAAAAGCGAATTTGAGTGACTTTCTTATTCGAGTTCAAAATGGGTCGTAAAGCAGTGGAGACAACTTGCAATATCAACAATGCATTTGGCCCAGGAACTGCTAATGAACGTACAGTGCGGTGGTGGTTCACGAAGCTTTGCAAAGGAGACGAGGGACTTGAAGATGAGGAGCATAGTGGCTGACCATTGGAAGTTGACAGCGACTACTCAAGAACAATAATCAAAGCTGATTCTCTTACAACTACACGAGAAGTTGCTGAACAATTCAACATTGACCATTCTATGCGGACGCGT 4 2 3' arm Homo_sapiens mirnest U6 0.00000002 hsa-mir-548am 0.000001 -19.7 .........(((((......(((.(((.(((.((((((....((((.......)))).......)))))).)))...))).)))...)))))........... (-19.7)