mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAAAGTAACTGCGGTTTTTGC CAAAACCGCAATTACTTTTGC TTAGACTGGTGTGAAAGTAACTGCGGTTTTTGCCAAAACCGCAATTACTTTTGCACCCACCCA TTTTTTTTTTTAGTTTAATCGGCCGTTTTACTCTCCCCCAAGTAAAACAGTCATGCACAATTTGCTGAAATTTTCCTTAGTGTACTTTGAAATCTGTGGAACAGAACTGGCAATCGCTAAATTCTATTTGACTCTAGTTCCATTTAATATTAGACTGGTGTGAAAGTAACTGCGGTTTTTGCCAAAACCGCAATTACTTTTGCACCCACCCAATAAGTATAAAATATGTAACTTCACTTAATTTTATCCTTTATGTATTTCCCTATATTATGTACCTATGGACATCAGACTTAGTACAGACTGATAAAAGGCTGAACAGACAACTCTGGTTTCAAAAATCCAGCTTCTCACAACATCAGACATACTAGTATACAGCTTTTCTAATTTCACAACACATGTCCATTTTTTGGTCTTTCACAATAGAGAAGATGTGTATACTTTTGAATACTCTGATCTGTCTACAATCTACCAAAATTGGAAAGTGT 4 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.0000008 hsa-mir-548am 0.000003 -28.4 .......(((((((((((((.(((((((((....))))))))).)))))))))))))...... (-28.4)