mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCAAAAACCACAATTACTTT AGTAATTGCAGTTTTTGCCAT TTAGGTTGGCGCAAAAGTAATTGCAGTTTTTGCCATTGAAAGTAATGGCAAAAACCACAATTACTTTAGCGCGCCGTTG CCGTTGTCAGTGACGCCGGAGAGTAAGTGTCATATTTAATAGAAAAATAGGAATTAGTAGCCAAATATCAGATACGGGGGTGAGGAAGAGGAAGGTGTCATTTTTCTGACGTCCATGCCAAAGGACTCTGTCTTATTTGGGACTATTTGAGACAGGATGAATGAATGTGTTAGGTTGGCGCAAAAGTAATTGCAGTTTTTGCCATTGAAAGTAATGGCAAAAACCACAATTACTTTAGCGCGCCGTTGTTCCCCCACTGACAACG 2 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 2e-26 hsa-mir-548aa-2 2e-20 -36.1 ...(((..((((.((((((((((..(((((((((((((....)))))))))))))..)))))))))).))))))).... (-36.1)