mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGTAATTGCAGTTTTTGC AAAACTTGCAGTTATTTTTGC ACCTATTTATTAGTTTGGTGCAAAAGTAATTGCAGTTTTTGCTGTTGAACGTAGTGGTAAAACTTGCAGTTATTTTTGCACCAACCTAATAGGATTT TTTACCAATTGTAGAGCACTGAACAGGGTGCTGTCTTAAAAGAGCAATTTACAGACATGAATTTGTGCATATTTGTAGATTTATTACATTAACTTGGGAGGGATATACATGTTGCTCTTACTGATCTTGATAATTTGCAAGTTTGAAAATTCCATTTTGGCACATTGTTTTGTAAAATTTATTCTCAATTATGAGACTCACACTGTAGATACTAGGTGTTTAATATGCTGCACGCAGTAGCTAAGCCATCTCCCACATGTATCAGTTTTCCAGTGTACCTAATTTAAACTTTAGCTAAATGACATATGCTATTTTTTGTAGATCTTGGTTCGGTTTAAAATCCTTGAAATTACAAAAATTTTAATTGGCAAATACACATAACCTATTTATTAGTTTGGTGCAAAAGTAATTGCAGTTTTTGCTGTTGAACGTAGTGGTAAAACTTGCAGTTATTTTTGCACCAACCTAATAGGATTTCCTGTTGGTTTTGATTCTTTTAAATAAGCGGCCTACTTATTTTATGTATTACAATTCTGTTGACTTAAAGTAAATGTATGCGATAATGTTTATTTTTATTCCTTTCAAATAAACCAGAATTTTTTCTTTCATTTGTAACTTAATTATGGCCTTAACTGAATCAACCTGAAGATAATGGAGTGAAGAAAGTGAAGTGTTATAACCCACAGCATCATATGTGATACCATAATGACTGTCTACACATAGCCGATCGTCGTGAGTGCTGTCACCTGCTGGTTTGGGGGTAGTAATGTGTCGCTTTAACTTTCAGAGTAATGGAGAAAGATCCTTTCCATGCAAGTTGGTTTACCTGTACATATAGGGACCCCTTGTAGAGCTGAATAAAGCCAATGAACTTTT 1 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 1e-19 mml-mir-548e 0.000000000001 -40.2 .....((((((((.(((((((((((((((((((((.(((((((((((....))))))))))).))))))))))))))))))))).)))))))).... (-40.2)