mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACACCAGTCGATGGGCTGT AGCTTATCAGACTGATGTTGAC GACATCTCCATGGCTGTACCACCTTGTCGGGTAGCTTATCAGACTGATGTTGACTGTTGAATCTCATGGCAACACCAGTCGATGGGCTGTCTGACATTTTGGTATCTTTCATCTGACCA GGGTCACACCATATTCGGTCACTTGGTTAGTGAAAACAGGAGAGGAGAAATATCTCATACAAGGTGAAAGGATACTGGAGAGAGAAATTACCCATTTCTAAAAAAAAACCACACTCTGTCGTATCTGTGTTAATGTTTTCTAGCATGTACTCTGGTTTCAACAGACACAAATTTATATGTTAACCCAGTTTTCTTGCCGTTCTGTAAGTGTTTTATTCTTAGTGTGATTTTTTTCCATTGGGATGTTTTTGATTGAACTTGTTCATTTTGTTTTGCTTGGGAGGAAAATAAACAATTTTACTTTTTTCCTTTAGGAGCATTATGAGCATTATGTCAGAATAGAATAGAATTGGGGTTCGATCTTAACAGGCCAGAAATGCCTGGGTTTTTTTGGTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTTTATCAAATCCTGCCTGACTGTCTGCTTGTTTTGCCTACCATCGTGACATCTCCATGGCTGTACCACCTTGTCGGGTAGCTTATCAGACTGATGTTGACTGTTGAATCTCATGGCAACACCAGTCGATGGGCTGTCTGACATTTTGGTATCTTTCATCTGACCATCCATATCCAATGTTCTCATTTAAACATTACCCAGCATCATTGTTTATAATCAGAAACTCTGGTCCTTCTGTCTGGTGGCACTTAGAGTCTTTTGTGCCATAATGCAGCAGTATGGAGGGAGGATTTTATGGAGAAATGGGGATAGTCTTCATGACCACAAATAAATAAAGGAAAACTAAGCTGCATTGTGGGTTTTGAAAAGGTTATTATACTTCTTAACAATTCTTTTTTTCAGGGACTTTTCTAGCTGTATGACT 1 1 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-21 5e-22 cgr-mir-21 9e-45 -40.1 ....((...((((..((((((...((((((((((((((((.(((((.(((((.((((.((...))))))))))).)))))))))))))))))))))...))))))...))))..))... (-40.1)