mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAACCACAATTACTTCTGC AAAAGCAATTGCGGTCCTTGC GCTAGCTAGATACCTAGCTGTCAGGTTGGAGCAAAAGCAATTGCGGTCCTTGCTGCAATTAAAGGTTATGGCAAAAACCACAATTACTTCTGCACCAACCTAACAGCTATCCATCCAGGGCT TTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTAGGTAAATGGATGCCTTTTATTTTAGGAAAGACATACTGAAGTATTTAGGTGTATGAACAAAACTGAGGTTTCCATGATGAAGAAGAAATTCCACTTGTGGACTTCAGGGACAGCTCCTGCATGTTTCCAGCCTGCACTTCCTGATAGCCTACCCTACAAATTTAGCACTTAACCATCTGGGGCCCAAAATTATGTAAACCAATTATTTGCAATAAATCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATCTATCTATCTATCTATCATCTATCTATCTATCTATCATCTATATATCTGTCTATCTGCCTTTCTAGCTAGCTAGATACCTAGCTGTCAGGTTGGAGCAAAAGCAATTGCGGTCCTTGCTGCAATTAAAGGTTATGGCAAAAACCACAATTACTTCTGCACCAACCTAACAGCTATCCATCCAGGGCTAGGGCTATCTATCTAGGGCTAGGGCTATCGATCTAGGGCTGTTAAAAGTGTATTCAACCCAAGGTATCTAATACACATAGTTTATAATGGCATGTGAGAAATAAACTCCTTCCTTAAAAGATTAAATATTACTTCTTTTTCCAAAACCTAAATTGTTTCATCAATTTCCACTAGAAATGTATCTTCAATAAGCAGGCTGGGCACAGTAGCTCATGCCTATAATCCCAGCACTTTCGACGGGCAAGTTGGGAGGAC 5 0 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-548 0.000000000007 hsa-mir-548aa-2 0.00000000003 -45.2 ...((((.(((...(((((((.(((((((.(((.(((.(((((.(((..((((((.(((.....))).))))))..))).))))).))).))).))))))).)))))))...)))...)))) (-45.2)