mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTACATATTAGCATTAACA TTAATGCTAATCGTGATAGGGGT CTGTATGCTGTTAATGCTAATCGTGATAGGGGTTTTTGCCTCCAACTGACTCCTACATATTAGCATTAACAGTGTATG GGAGCCGCCCGCAGAGCAAGCGCGGGGAACCAAGGAGACGCTCCTGGCACTGCAGATAACTTGTCTGCATTTCAAGAACAACCTACCAGAGACCTTACCTGTCACCTTGGCTCTCCCACCCAATGGAGATGGCTCTAATGGTGGTACAAACCAGGAAGGGGAAATCTGTGGTTTAAATTCTTTATGCCTCATCCTCTGAGTGCTGAAGGCTTGCTGTAGGCTGTATGCTGTTAATGCTAATCGTGATAGGGGTTTTTGCCTCCAACTGACTCCTACATATTAGCATTAACAGTGTATGATGCCTGTTACTAGCATTCACATGGAACAAATTGCTGCCGTGGGAGGATGACAAAGAAGCATGAGTCACCCTGCTGGATAAACTTAGACTTCAGGCTTTATCATTTTTCAATCTGTTAATCATAATCTGGTCACTGGGATGTTCAACCTTAAACTAAGTTTTGAAAGTAAGGTTATTTAAAAGATTTATCAGTAGTATCCTAAATGCAAACATTTTCATTTAAATGTCAAGCCCATGTTTGTTTTTATCATTAACAGAAAATATATTCATGTCATTCCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACATGTC 0 2 3' arm Homo_sapiens mirnest mir-155 1e-18 hsa-mir-155 3e-31 -32.1 ..(((((((((((((((((((.(((.((((((((.(((....)))..)))))))))))))))))))))))))))))). (-32.1)