mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAACGGTGAGATTTTGTTTG GAGAAAATCTCGCTGTTTTAG TTCTAACTATAACATTCTTCAATTTTATTTTAAAACGGTGAGATTTTGTTTGGTCTGAGAAAATCTCGCTGTTTTAGACTGAGGCAGTGTGTTATGATAGAGAGC AGCGGGGAACAATCACTTGCAGCAGGAGGTGTAGGTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTAGGTGATAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAATAAAACAAAACTACCAGACCTTGAATCCTAATTTCTTAGGGTTATCACCAGAAGGAACATTGGCTGCTTGTCAATACCACCATAGGTGGTAGAGGCAGGAAGTTGTAACTAGAGATGTCTTTATCATGGTCTCAGTTACTATAACCATTTGGATCTTAGTTTCCTTATATGTTGAGCAAGAAGATTAGCCTGGAGAATCTCCAAAATCCTTCTAACTATAACATTCTTCAATTTTATTTTAAAACGGTGAGATTTTGTTTGGTCTGAGAAAATCTCGCTGTTTTAGACTGAGGCAGTGTGTTATGATAGAGAGCACTAAACAGAGAGTGAGAAGACCTAAATTTTAGTCCCATGTCCTGTCATTATCATGCATAGTGACTCTGGGCTTTCCTTATCTGAAAAATGATATGGGACCGTGATGGTGATCTATGTNTAAGGAT 3 0 5' arm Homo_sapiens mirnest mir-553 1e-19 hsa-mir-553 2e-30 -31.6 (((((..((((((((.((....(((((.(((((((((((((((((((.((......)).))))))))))))))))))).))))).)).)))))))).)))))... (-31.6)