mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAGATGATCATCAACAAACA TTTTGTTGCTGGTCATCTAGTC GCTATGAATATGTTTTGTTGCTGGTCATCTAGTCATTGTTAGTCATGTTTAAAGCTCATGGCAGGATGATTAGATGATCATCAACAAACACATTCAGGA GCGTTGTTTTTCTTGCAAAATGCTCAAGGTCTAGTATGTGTTTTGCAGCTATGAATATGTTTTGTTGCTGGTCATCTAGTCATTGTTAGTCATGTTTAAAGCTCATGGCAGGATGATTAGATGATCATCAACAAACACATTCAGGATAATGCATCACATCACGGCTGTGTCTCTCCCCCCCCTCTCTCTCATTCATGGGTGTGCGTGCACAAATAGTTATTGTTTACTCTGAATTGGAACCTATTTTTTTTTAGTTTGATGATCCTTCCTTTGTCTTCTGATTTTGTCTGTCTGCATAGATGGTATGTCTTTGTCTCTCAAACGCTGCAAATGATGCTCACTTTTTCTGTGTGGCCCACTAAAACTGTCATCTGCTGATTCAACATTGATCACCTTTGAGGTTTGTTATGATTTCTTATGAAGATGGAAGATGTGTTTGTATTTGGACCATTGAAAATATTTTGTTAGAAGTTAAAGGATGAGGGTTAAAGCAGTTGGACACCTCGCCTCTGAATTGTACTTCGATTCTTCCCCCTAATGGAGGGTAACAGATATAGTAATTGACTTGATCTAAATTAAACTGC 1 1 3' arm Vitis_vinifera mirnest 100 osa-MIR827b 0.00002 -35.4 ....(((((.(((((.((((.((((((((((((((((....((((((.........))))))..)))))))))))))))).))))))))).)))))... (-35.4)