mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATGTTGTCTGGCTCGAGA TCGGACCAGGCTTCATTCCCC TAAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGAGGTCTTATTAGCTTCATGAATTGTTTGATTTGATGATGATTAGTCAAAGTGACTAATAATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCATCCAA AGTTGGTGGTTGAGGGGAATGATGGCTGGCTCGAGGCTTCAATTTGGTTTGGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACTAACTAAACTCCATCATTATATTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCATGAGGGAGGTGGTGGCTGCTTCTGCTGCAAAGGTTAAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGAGGTCTTATTAGCTTCATGAATTGTTTGATTTGATGATGATTAGTCAAAGTGACTAATAATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCATCCAACCTTTGCTATATGCTTCTACTTCTGCTTGCTTCCACTTTCTTTTTAATGTTAAGTTCCTCTTTTGCAACCTCCAAGTTTTCCAAATTAATTATAATGGAAAATAAAATGAACTGGCAAGTGAGCCAGAACAATGCAGATCAAGGCAGAACAAGTTGAAAGGCTCTTCTGCATCGTGAAAACTATAGTGATTTGAAGGGAACCTGCTT 3 0 5' arm Arachis_duranensis mirnest mir-166 1.0E-7 ptc-MIR166q 2.0E-9 -36.1 ...((.((...((((((..((((((.((((((.(((..(((((...((.....)).)))))..)))....((((((((...))))))))..)))))).))))))..))))))...)).)).. (-36.1)