mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAGCATCATCAAGATTCACA GGAATCTTGATGATGCTGCCG GGGGGAGCATCATCAAGATTCACAAGTATTGAGACTCAGTGCGTGGTGGTGATGGTGACTTATGTGGTCCCTTCCTACACTCCGATGGCTCTTTGATATGGGAATCTTGATGATGCTGCCG GGGGGAGCATCATCAAGATTCACAAGTATTGAGACTCAGTGCGTGGTGGTGATGGTGACTTATGTGGTCCCTTCCTACACTCCGATGGCTCTTTGATATGGGAATCTTGATGATGCTGCCGTGGCAATAAATGGCTAAATTTTTATATAAATCATCTCCAAAACCACAAAACAGTTGCAGACGATCGAGGACG 2 0 5' arm Vitis_vinifera mirnest mir-172 2e-55 vvi-MIR172c 1e-56 -48.2 ..((.((((((((((((((((.((.((...((((.(((...((.((((..((.((.((((.....)))))).))...)))).)).))).))))..)).)).)))))))))))))))).)). (-48.2)