mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCATTCATATGAACCCT GGTTCATATAATGGTCAACA TCAGTGGTGTCATGGTCATTGTTGACCATTCATATGAACCCTGCAATTGCATTGCAGCTTGTGTGGGGTTCATATAATGGTCAACAGAGACCCTTGACATCAAA TTACGGCCGGGCACTAACACGTTTTTATTGACTGCACTAATGANCTAGGACTTGTTTTAGGTTATAAATAGGCTTCCATCTTCAACAAATACCTTCATTCTTCACTTCACCTTCTTTCTTCCATCTTCTTCAAAAAAGATTAATTTTTTAGGGGTGTCAGTGGTGTCATGGTCATTGTTGACCATTCATATGAACCCTGCAATTGCATTGCAGCTTGTGTGGGGTTCATATAATGGTCAACAGAGACCCTTGACATCAAAGAAAAGCACAAAAAAACACATAACAATATGGTCCGGATTTCATTTTCCAGAAATCACTAACAATTTGGTCCGAATTATATAATCCGGACCAGGGATATTTTTGAAAATTTTGCAGGGCGCGCGAGAAGGCAGCAAGATGGAAAAAGTAATACTCAAGATTAAATAGCCTACGTGACGTTTCATTTTGTATGGTTACTTGATAATTCCTTTAAAATTGCTCATATTTCTGAAATAAGTCGATTGAGAGATTTATAC 0 1 5' arm Medicago_truncatula mirnest MIR2587 5e-37 mtr-MIR2587f 5e-43 -53.9 ....((((((((.((((.((((((((((((.((((((((((((((.((((...))))....)))))))))))))))))))))))))).))))..)))))))).. (-53.9)