mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCGTTCATAGGAACCCT GGTTCATATAACGGTCAACA CTTCCATTTTCTTCNAATGTTTTTTTGTTTTTTAGGGGTGTCGATGGTGTCATGGTCATTGTTGACCGTTCATAGGAACCCTGCAATTGCAATGCATTGTAGCTTGTGTGGGGTTCATATAACGGTCAACAGAGACCCTTGACATAAAAAAAGACACAAAAAATTAAATAACATCTGGTCCAGATTTCT TTACGGCCNGGNNGCATTCCGGAATATATAATCCGGAAGCACATCTGTTTTCCGGAATATATTTTCCGGATTAATGCGATAATGGTGGTGAACGAGGGAAAAGTTGACACTTTCTATAGGGCTAAGGACATTCCGAAATGTAAAATCTGAAAAGATTCAGAGCCATTAATGTGGGTTTGGACGATAACAACAACCACCAACACGTTTTCGTTGACTATATTAATGACCTANACTTGTTTTAGGCTATAAATAGGCTTTCATCTTCAACAAATACCTTCATTCTTCACTTCACCTCTTTTCTTCCATTTTCTTCNAATGTTTTTTTGTTTTTTAGGGGTGTCGATGGTGTCATGGTCATTGTTGACCGTTCATAGGAACCCTGCAATTGCAATGCATTGTAGCTTGTGTGGGGTTCATATAACGGTCAACAGAGACCCTTGACATAAAAAAAGACACAAAAAATTAAATAACATCTGGTCCAGATTTCTGTTTCCAAAAATCACTAACAATCTGATCCGGATTATACAATCCGGACAAGGGGTATTTTGGTCAAAATCATAAGGCGCGCGAGAAGGCTGTANGGTGGAAAAGTAATAGTCAACACGTTATGCGTCTTANGCATCTTTAAACAGGGAGAGGAGAAAAATATGTGGTTTGTTCNGTATATTAAGGATCATAGTCCAGATATGACATTGATGACCGATTNGGGTTTTTATTATTTAGAANNNTTAAATGCTCNTTTGNTCCCNTNAGTATTTAAGTTTTTTTTAGTCTCGTTTTGGTCCATTCTGTTANNTTTNCGTTAGGGTTTAAAAAAANTTAACTCCTGGACACGTGTCACCTTATCATCATCNTGTCCTGGACANNTGTCACCCTAANCNTATGTAAAAACTAAAACACTAAACAATGGCTNNT 1 1 5' arm Medicago_truncatula mirnest MIR2587 3e-40 mtr-MIR2587c 2e-44 -63.9 .........(((((..(((((.(((.(((((((....(((((....((((((.((((.((((((((((((.(((.((((((((((...((.((.....)).))...)))))))))).))))))))))))))).))))..)))))).......)))))))))))).))).)))))..))...)))..... (-63.9)