mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTCCCTAAATA TTTAGGGACGGAGGGAGTATG AGATTGAAAAATACTCCCTCCGTCCCTAAATAAATGACCTAGTTGACTCTGACACACATATCAATGCATATGTTTTATCTTTGATATCTTCAATTCTCTACTAAAAAAAATTATAAAATTTAATATTTTAAAAATACTCATCGAGACGAATCCAACAACATCTTACATGATATTATTTATCTTTGTGAATTAGTATAAAAGTATAGTCAAAGTATGTCAAGTCAATTATGTATATTGTCAACTGGGTCATTTATTTAGGGACGGAGGGAGTATGTTTTATGA CACGTGGCAGAAGTTGCACAGTCNGCNACNGCCACNTGGCANAACCCATGCCATATCATCAAAAATGTGGGGCCAGGGNCATTTTTCNAACNAAAAAGTTTTTNCNGGGANGTTTTTNNAACATTTTTTTTTNCNGGGACNAAAATNAAAACNGACCCNAATTACNAGGATGAAAATCATATTTAAACCTAAAATATATTATTTTTAGATGCTTTACCTAAAACATTAATCTAGAATCGTGATGATTCTGCATAAAGATTGAAAAATACTCCCTCCGTCCCTAAATAAATGACCTAGTTGACTCTGACACACATATCAATGCATATGTTTTATCTTTGATATCTTCAATTCTCTACTAAAAAAAATTATAAAATTTAATATTTTAAAAATACTCATCGAGACGAATCCAACAACATCTTACATGATATTATTTATCTTTGTGAATTAGTATAAAAGTATAGTCAAAGTATGTCAAGTCAATTATGTATATTGTCAACTGGGTCATTTATTTAGGGACGGAGGGAGTATGTTTTATGAAAATAACCAAGTTTTTAGACGTGTGTTTTTGTCCTANGTCATCCAAAAATAGAAAATCGTTGCACGGAACGAAGTTGACAAAGACAATGATGAACAAAACAAATTTTAGAATGTTGATTATCTCGAGAAGAGTATTATATGAATTATGTCACATTTACATAACACCACCATTTTTATTATCAATGACCGGTCTCCCTAACCGTCACCTCCTTCTCCACCAACGTAAAAGTCTATAACATTTTCACGACCGCCCCTTATCAATATCAGTCCCCTTTCCATCATCNNGGGGTTCTATGTCGGTTGCACCACCACCTTTTCCGTANCTGGAAATNGGNTTGACATATCCAGCACCACCCCATGTTCTACCGCCGCCAACCTTTCCACCACCNNCGCCTTTCCA 0 0 5' arm Medicago_truncatula mirnest MIR806 0.000004 osa-MIR1862e 0.001 -80.5 ....(((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((..(((........)))(((((((...((.((..((((((((((.....((.((((..((((.((((.......)))).))))....((((((((.((((.((((.....((.(((......))).)))))).)))).))))....))))...)))).))...))).))))))))).)).)))))))...))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))... (-80.5)