mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
CCTCTTCCTCTTCCTCTTCCT GAAGAGGACGATGAAGATGAG GGGGNNGAGGAATANAAGAAGANACAGAAGAGGAGAGACAACCGCAGGAACAGAACAGTGACGAAGAGGACGATGAAGATGAGAAAGAACTTTTCAATGGCAGTCGAATTCACGACCTAAATGCTTCACCAACCCTCAACAAGATTCATCGAGCTTCGGTCACGTACCAACGACGACCTCCCTCTCGAGGTAACTGGTCAAGAATCCAATCAGTTCAACCAAGAGAAAGGCCTTCCATGACTAACCCACTCCCGCCTGGTGAGGATCCGCAATCACCAGCTGCTCCAAGAAAACAAACCATGTCACCAATGGCAGGAGGACCGATGCCTGGACTTGGTGCTTTTGACCCAACCGCCGTTAAACTTAAAGCGGCTCACCGGCCAACCGTCACCGGCGCCACCGCCACTCCTCCTGCTGGCGTCTTTGTTGCACCACAACTGAGGAAAGTGAACCGAGAGGAGAGGTCTGGAAGCGCCGTCGCATTGACCTTCAACAACAACAACGTTCCTCCTCAAGAAAGAATTCCTCAACCATCTCCTCTTGAAAAAAGGCGCTCTGCAGAACTTCCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCG GNNTTACGGNCGGGGNNGAGGAATANAAGAAGANACAGAAGAGGAGAGACAACCGCAGGAACAGAACAGTGACGAAGAGGACGATGAAGATGAGAAAGAACTTTTCAATGGCAGTCGAATTCACGACCTAAATGCTTCACCAACCCTCAACAAGATTCATCGAGCTTCGGTCACGTACCAACGACGACCTCCCTCTCGAGGTAACTGGTCAAGAATCCAATCAGTTCAACCAAGAGAAAGGCCTTCCATGACTAACCCACTCCCGCCTGGTGAGGATCCGCAATCACCAGCTGCTCCAAGAAAACAAACCATGTCACCAATGGCAGGAGGACCGATGCCTGGACTTGGTGCTTTTGACCCAACCGCCGTTAAACTTAAAGCGGCTCACCGGCCAACCGTCACCGGCGCCACCGCCACTCCTCCTGCTGGCGTCTTTGTTGCACCACAACTGAGGAAAGTGAACCGAGAGGAGAGGTCTGGAAGCGCCGTCGCATTGACCTTCAACAACAACAACGTTCCTCCTCAAGAAAGAATTCCTCAACCATCTCCTCTTGAAAAAAGGCGCTCTGCAGAACTTCCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTCGGTTCNAGCGTTGGAAGCGAAGCCAAAACCAGCGAACGAGAAAGANGAAGCTCTGAGTTCTTCACCGTCTTCAAGAAANNNNGANAAAAACGAGAAAGTTGCTTCTCCCAAGAANAAAGGNAAACTCTGCGTGATTT 4 0 3' arm Medicago_truncatula mirnest  100  100 -159.4 ((((..((((((.....(((((....(((((((((((........(((((.((((.((.((.((((((((.((.(((((.(((...(((.((((((..((((((((......)))).....))))((((((..............((((.((((((.((((.(((....)))..))))....((((..((((((((((..........)))))))..)))..)))).))))..)).))))................))))))(((...(((.........))))))..((............))......((((((((((..((((..(((...(((((...(((...)))..((((((........)))))).))))).)))..))))...((((....))))..))))))))))(((((((((((((.....)))).((((((.((..........((.(((((.....(((....)))...)))))))..........)).)))))).((((((.(((............)))..))))))..))))))))).)).)))).))).))).))))).)).)))))))).))...)).)).)).)))))....))).)))))))).)))))...))))))..)))).... (-159.4)