mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTGTAATCCCAACACTTTGG AAAGTGCTGGGATTATAGGTC ACTAATTATTTTTGTAGAGATAGGATNTCACTGTGTTGCCCGGGCTGGTCTCAAACTTCTGGCCTCTAGTGATCCTCCCGCTTTGGACTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTCTGAGCCACCATGCCCAGTCAGCGTTTATCANATTACTTACCATCACTACTTTGTCCTGGGGAAATCCTCTTAATCCTTAAAGGNGCAATCCAAAATCATAATGTTCCCGTGTTACTTACTGTTACTTTTTTTTTTTCTCCTATAGTGGTTTGATGATAAGAACCCAATTTGGGCCGGGCGCGGTTGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTAAGCCAGATGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTTGAGACCATCCTGACCAACATAAAGAAGTCCTATCTCTACTAAAGACACAAA TTACGGNCGGGGNNGGGGTATTACTCTGTCATCNNGGCTGGAGTGCAGTGGCATAGTCATGGCTCACTGCAGCCTTGAACNCCCAGGCCCAAGTGATCCTCCCNCCTCANCCTCATGAGTAGCTGGGACCNCNGGNGTGCNCCCCATGCCCAACTAATTATTTTTGTAGAGATAGGATNTCACTGTGTTGCCCGGGCTGGTCTCAAACTTCTGGCCTCTAGTGATCCTCCCGCTTTGGACTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTCTGAGCCACCATGCCCAGTCAGCGTTTATCANATTACTTACCATCACTACTTTGTCCTGGGGAAATCCTCTTAATCCTTAAAGGNGCAATCCAAAATCATAATGTTCCCGTGTTACTTACTGTTACTTTTTTTTTTTCTCCTATAGTGGTTTGATGATAAGAACCCAATTTGGGCCGGGCGCGGTTGCTCACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGCTAAGCCAGATGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTTGAGACCATCCTGACCAACATAAAGAAGTCCTATCTCTACTAAAGACACAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGCATGCCTGTATTCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGAAGANTCGCTTGAACCCAGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCNTTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCGAAATTCNGTCTTNNAAANAAAAAA 1 0 3' arm Medicago_truncatula mirnest Metazoa_SRP 6e-31 hsa-mir-5096 0.00000000000002 -164 ........((((.(((((((((((((.((..(((((((..((((.(((((((((((((((((((((..(((((((((..((((....(((((((((((.(((((((((((((.(((((.(((.(((((.(((................((((.((((((((((.......(((((((.......((.....(((((.(((.........(((.........)))........)))..))))).)).)))))))...))))))..)))).))))...........))).))))).))).))))).))))))))))))).)))))))))))...))))..)).)))))))..))))))))))))))))))))).))))..)))))))..)).))))))))))))).))))....... (-164)