mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGTTCGGCTCGTTAGGTTCA AACCTGTCTGAGCTCGACTCGAT GGAAATGAGATGAGTCAAATTGAACCTGTCTGAGCTCGACTCGATAAAATTTTGTTCAGCTCGAAACTCGACTCTAGTTCGTTACGAACATATTTTTCAGCTCGAACTCGACTCGGTTCGAGTTCGCAAACAACTCGGTTCGGCTCGTTAGGTTCAGTTCAGTTGCTCGAATAAC CGGCCGGGGANGNGTTTGTATTATGTGTTCTACCAACTGCGGACTGAAATTAGCTTGCATAAAAGGAACATTCCAGGCTTTTAGATCTTGTAGCAGGCAGTCTTTTACTCGCAAATCTGCTAAAGTAGAACCATCACTGACCGGCGGTGTAATAATAATATTATCCAGTAACCAATTATTATTCCACACCGGTAGGGCTGGAAATGAGATGAGTCAAATTGAACCTGTCTGAGCTCGACTCGATAAAATTTTGTTCAGCTCGAAACTCGACTCTAGTTCGTTACGAACATATTTTTCAGCTCGAACTCGACTCGGTTCGAGTTCGCAAACAACTCGGTTCGGCTCGTTAGGTTCAGTTCAGTTGCTCGAATAACATAATTTAAAAGTCATTTTTTTGCC 2 2 3' arm Medicago_truncatula mirnest 100 mtr-MIR2614 0.0000000000006 -52.2 ..........(((((..(((((((((((..(((((.(((.((((......(((((..((((((((..((((.((.((((((....(((.......)))....)))))).)).)))))))))))).)))))....)))).)))))))).))))))))))).....)))))...... (-52.2)