mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGA TGGCTGCTTCTGCTGCAAAGGTTAAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGAGGTCTTATTAGCTTCATGAATTGTTTGATTTGATGATGATTAGTCAAAGTGACTAATAATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCATCCAACCTTTGCTATATGCTTCTACTT AGTTGGTGGTTGAGGGGAATGATGGCTGGCTCGAGGCTTCAATTTGGTTTGGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACTAACTAAACTCCATCATTATATTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCATGAGGGAGGTGGTGGCTGCTTCTGCTGCAAAGGTTAAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGAGGTCTTATTAGCTTCATGAATTGTTTGATTTGATGATGATTAGTCAAAGTGACTAATAATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCATCCAACCTTTGCTATATGCTTCTACTTCTGCTTGCTTCCACTTTCTTTTTAATGTTAAGTTCCTCTTTTGCAACCTCCAAGTTTTCCAAATTAATTATAATGGAAAATAAAATGAACTGGCAAGTGAGCCAGAACAATGCAGATCAAGGCAGAACAAGTTGAAAGGCTCTTCTGCATCGTGAAAACTATAGTGATTTGAAGGGAACCTGCTT 5 0 3' arm Arachis_duranensis mirnest mir-166 0.0000002 pvu-MIR166a 0.000000000009 -49.5 .((..((.......(((((((((..((.((...((((((..((((((.((((((.(((..(((((...((.....)).)))))..)))....((((((((...))))))))..)))))).))))))..))))))...)).))))))))))).....))..)).... (-49.5)