mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTCTGGCTCGAGA TGGCTGCTTCTGCTGCAAAGGTTAAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGAGGTCTTATTAGCTTCATGAATTGTTTGATTTGATGATGATTAGTCAAAGTGACTAATAATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCATCCAACCTTTGCTATATGCTTCTACTT AGTTGGTGGTTGAGGGGAATGATGGCTGGCTCGAGGCTTCAATTTGGTTTGGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCTCTCAAACTAACTAAACTCCATCATTATATTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCATGAGGGAGGTGGTGGCTGCTTCTGCTGCAAAGGTTAAGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGAGGTCTTATTAGCTTCATGAATTGTTTGATTTGATGATGATTAGTCAAAGTGACTAATAATCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCATCCAACCTTTGCTATATGCTTCTACTTCTGCTTGCTTCCACTTTCTTTTTAATGTTAAGTTCCTCTTTTGCAACCTCCAAGTTTTCCAAATTAATTATAATGGAAAATAAAATGAACTGGCAAGTGAGCCAGAACAATGCAGATCAAGGCAGAACAAGTTGAAAGGCTCTTCTGCATCGTGAAAACTATAGTGATTTGAAGGGAACCTGCTT 5 0 3' arm Arachis_duranensis mirnest mir-166 2.0E-7 pvu-MIR166a 9.0E-12 -49.5 .((..((.......(((((((((..((.((...((((((..((((((.((((((.(((..(((((...((.....)).)))))..)))....((((((((...))))))))..)))))).))))))..))))))...)).))))))))))).....))..)).... (-49.5)