mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCGGACATTGTAAGAACGGCC CCGTTCTTACGACGTCCGGTT CACGATTAAGGGCCGTTCTTACGACGTCCGGTTAAAGTTAACCGACACTTAACCGGAAGAATTCTGCCGGTAATAAAATCTGTTATCAGTCGGTTAGCGTTAACCGACACTTTACCGGACATTGTAAGAACGGCCCTAAAGATA CACGATTAAGGGCCGTTCTTACGACGTCCGGTTAAAGTTAACCGACACTTAACCGGAAGAATTCTGCCGGTAATAAAATCTGTTATCAGTCGGTTAGCGTTAACCGACACTTTACCGGACATTGTAAGAACGGCCCTAAAGATAGTATGGTTGCCCAACGAACTATGATAAGAAACAATTTTAATGATGCTCATAGTTTCTTTTACTATCAACAACACTCTAGAAGCTTTTACTAGTGCTGATGGCGTAAAAATTAAATACTAGCCACTACTAGGCATACAAATTATATGATTTATATATATGATTCAATATTTAAACGCTTGGAGCGCCAATGCTCGGTTCCGCTAATCGTTGTGATAACAAGGGAACTCGGAGCATCACTTTATTATGGTTCGTTGTGCAACCATACTATCTTTAATCGTGGTAAATCTCAACCAGTGTGATAGTGTGTGTGACGTGTGTGTACGCGTATGTCGGCGTTTTCCTTGTGCTTGGGCACAGCTGATGCCCGCGGGACGGACAGCTGCACTATCGCATAGTAGTACCTATAAACTAATGGACAGTCTGCGGATTCCACTCCGCCAACAATGCCGTCAATGCGCGGGAATCATAATATTAGAGAAAGAAAGGAGAAAGAACGAAGAGAAAAAAAAAGAGAAAGAACATGAATAGGGAAACAATAGACGTATGAGACTAACACTGCATTTCCCCCACGTTCTCTTTTCTCTTTTACTCTATATCGTACCACTGACCTCTCCCTCTAAGCGCTGTCCGTTAGTTTATAACGTCTATGCATGCTACCGAACGTTATCACACCATTATAGTGGATATTATCATCGTTACAGAGTACCTGAACAGTAGTTTGCAGTTTAAATGGATGTGT 1 0 3' arm Acyrthosiphon_pisum mirnest 100 api-mir-3015a-1 0.00000000003 -59 .....((.((((((((((((((((.(((((((.(((((((((.((...((((((((.((....)).)))))..)))..)).))))...((((((((....)))))))))))))))))))).)))))))))))))))).)).... (-59)