mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTAAAAGATTCGTCTCGCAA GCGAGACGATTTTTTAAATT TTAGCTACTATAGTATTTTTGTTTTATTTAGTAATTAATATTCACTCGTAGATTAATTAAGTTTAAAAGATTCGTCTCGCAATTTACAGACAAACTGTGTAATTAGTTTTTTTGTCTAATATTTAATGTTCCGTGCACATGTCCAAAGATTTGATATGATGGATAAAAATATTTTGAGTGTGGAACTAACAAGGCATAACAATTACCAATGTGTCCATGATTGGAAAACTCACACAGTAGTACTTCGAGCCTGTTCGTTTTTCTTTTCGGCCGTACTTTTTCTGTTAGCTATGAGTGTTTTTCTCTTACAATAAATTAGTCAATAGTAATTCAAACCAGCGAACAGTAAGTGTAGTGAACCTTAGTGCATCCTAAAACAGTGTGTACAAATCGATAATATTTGGATACATGTATAAAGTATTAAATGTACACTACTTACAAAACTAAAAACATAGATAGAGAATAATTTGCGAGACGATTTTTTAAATTTAATTAGTCTATGGTTAAACACTAATTGATGTAATTACAAATCCTATAGTATGTATTA GCACGAGGATGAAAGGGAAGATCATAGTTTTGCTTTATTTCAGCAAGATATAGTACTAAAAAAAATATTGTACAGTACTATAAAGTCTTGTTTAGTTTCAAAAAGTTTTTGATTTAGCTACTATAGTATTTTTGTTTTATTTAGTAATTAATATTCACTCGTAGATTAATTAAGTTTAAAAGATTCGTCTCGCAATTTACAGACAAACTGTGTAATTAGTTTTTTTGTCTAATATTTAATGTTCCGTGCACATGTCCAAAGATTTGATATGATGGATAAAAATATTTTGAGTGTGGAACTAACAAGGCATAACAATTACCAATGTGTCCATGATTGGAAAACTCACACAGTAGTACTTCGAGCCTGTTCGTTTTTCTTTTCGGCCGTACTTTTTCTGTTAGCTATGAGTGTTTTTCTCTTACAATAAATTAGTCAATAGTAATTCAAACCAGCGAACAGTAAGTGTAGTGAACCTTAGTGCATCCTAAAACAGTGTGTACAAATCGATAATATTTGGATACATGTATAAAGTATTAAATGTACACTACTTACAAAACTAAAAACATAGATAGAGAATAATTTGCGAGACGATTTTTTAAATTTAATTAGTCTATGGTTAAACACTAATTGATGTAATTACAAATCCTATAGTATGTATTAAACTTTAGTGCC 0 1 5' arm Sorghum_bicolor mirnest 100 osa-MIR2124h 0.00000003 -111.531 ...((((((((((....(((((.((((....((((((........((((((((((((((((((((((((((.((((((((((.(((........((((((..(((((((...(((..(((((((.....(((((...((((((.((...)).)))))))))))...)))))))(((((...(((((.((((.(((......(((((...((((((((....)))).....))))..))))).......))))))).)))))....)))))....((((...(((((.(((.(((((................................)))))....))).))))).))))((((((.((.(((((((...........((((((.(((((.......))))).)))))).......)))))))..)).))))))..))))))))))..))))))........))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))........))))))..))))..)))))..)))))))).)).... (-111.531)