mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCGAGACGAATCTTTTTAGC TTAATAAATTTGTCTTGCAGT ACATTAAATGTAGATAAAAAAATAAACTAATTACACAGTTTAGTTGAGAATCGCGAGACGAATCTTTTTAGCCTAGTTACTCCATGATTAGCCTTAAGTGCTACAGTAACCCACATATGCTAATGACAGATTAATTATGCTTAATAAATTTGTCTTGCAGTTTCCTGACGAGCTATGTAATTTGTTTTTTTATTAGTTTCTAAAAACCC ACGTGCTGCTGCGGATTCAGAGGGAAGGTGGCCTGCAGTTTCCACTCACCACTGACAACATCAAAACAGTGATCGGAGTAAGGCCTTCACCACCCAAAAATTTTTCATCCATCCCATCGAATCTTTGGACACATGCATGCAACATTAAATGTAGATAAAAAAATAAACTAATTACACAGTTTAGTTGAGAATCGCGAGACGAATCTTTTTAGCCTAGTTACTCCATGATTAGCCTTAAGTGCTACAGTAACCCACATATGCTAATGACAGATTAATTATGCTTAATAAATTTGTCTTGCAGTTTCCTGACGAGCTATGTAATTTGTTTTTTTATTAGTTTCTAAAAACCCCTCCCGACATCCTTCCGACACATCCGATGTGACACTAAAAAAAATTTCGTTCCCAATCTAAACAGGCCCTAAGCACGCTGCATCTTCCAGATCCACAC 5 0 5' arm Sorghum_bicolor mirnest 100 osa-MIR2124a 0.0000000000002 -48.2 ((((...)))).((((((((((((((....(((((.(((((.((((.(((..(((((((((((...((.(((.((((((.((....((((((..((.(((...........))).)).))))))....)).)))))).))).))...)))))))))))...))).))))))))).))))))))))))))))))).((((....)))).. (-48.2)