mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAATAAGACGAGTGGTCAA GACCACTCGTCTTATTCAAAG CCATGTACCATAATAGGGTACTCAATCCATCCCAAATTGTAAGTCGTTTGACTTTTTTAATATCAAGTTTGACCACTCGTCTTATTCAAAGTTTTGTATAAAATATCACTTTTTTTTTGTTGTGTATTGGTTTATTAATAAAAGTTCTTCAAGAATAACTTAAATTTGACTATATTTGCACAAATTTTTTGAATAAGACGAGTGGTCAAACTTGGTGTAAAAAAAGTCAAACGACTTACAATTTGGGATGGAGGGAGTACTACTGTACCATCTTTTTT CCATGTACCATAATAGGGTACTCAATCCATCCCAAATTGTAAGTCGTTTGACTTTTTTAATATCAAGTTTGACCACTCGTCTTATTCAAAGTTTTGTATAAAATATCACTTTTTTTTTGTTGTGTATTGGTTTATTAATAAAAGTTCTTCAAGAATAACTTAAATTTGACTATATTTGCACAAATTTTTTGAATAAGACGAGTGGTCAAACTTGGTGTAAAAAAAGTCAAACGACTTACAATTTGGGATGGAGGGAGTACTACTGTACCATCTTTTTTATATACAAGAGTCGAGTCGAGAGTGTACCCATTTTGTATCGTGGAGATCAGAAGCTCCATGCATGCCATGCAAATCGA 0 0 3' arm Sorghum_bicolor mirnest MIR806 7e-79 osa-MIR818e 0.00000000002 -121.1 ............(((((((((((..(((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((...((((((.......(((..(((((...((((...(((......)))...))))..)))))..))).......))))))..)))))..)))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))..))))))).))))............ (-121.1)