mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGGCCTCCTCGTGCTCCTCC ACGAGGACGAGGAGGCCGCCT TCGACGACGAGGACGAGGACGAGGAGGCCGCCTCCATCCACATCCATCCCGCCTCGCCTCAGCTGTCTCCGACCGCCCTCTGCCTACTTTTACTCCTACTCCTCCCCGTCGGCGTCGTCGTACAACGGCTGGGCCGACCTCGCCGCGGCGCCCGACACCCCTTTCCCCTTCCCCTTCCCCCTCTCCCTCCCGCCGCAGCCCACCACGCATGGCCTCCTCGTGCTCCTCCCCACCGTCG AGCTGGCAGTGCATCCCTGTCCTGTCTCCTATCCAGCTATCCTGTCCGATGGCTGCAGGTTCCTCCCCCTCCACCTCCAGCAGCCGGAGCCTCCTCGCCACCCGACCCTTGTTGCCGTTGAGGTCGACGACGAGGACGAGGACGAGGAGGCCGCCTCCATCCACATCCATCCCGCCTCGCCTCAGCTGTCTCCGACCGCCCTCTGCCTACTTTTACTCCTACTCCTCCCCGTCGGCGTCGTCGTACAACGGCTGGGCCGACCTCGCCGCGGCGCCCGACACCCCTTTCCCCTTCCCCTTCCCCCTCTCCCTCCCGCCGCAGCCCACCACGCATGGCCTCCTCGTGCTCCTCCCCACCGTCGCGCTCGCCCTCGCCCTCGCCCGCCTACCTCCCCTCCCCCTCCTCGCGGCCGCTTTCACCGCTGGATTCGCAGCCAGGCACCTGTCCTCCTCAGCGCAGCCAGAGTCCCCCCGCCGCCTCTCCGCCCTCCTCGCCGATCTCGATGCCCAGGCCTGCGCCTTGAGGGACGAGCTGCTCTCCGACGCCCGCCCGGGCCTCCTCGTCCAGGCCGTCGATCGCCTGCGCGATGCCGTCGCTGACGCCGCCAGAGTAGCCGCGCAACAAGGCGACACCGTGTCAGATGCGCTCGGNACCGCTCTGGGAGGTCGTCGACTATCTCGGTGCCTGGGCTCGCCACGCCGTGCGGGACCTCAGCCTCAGCTC 4 0 3' arm Sorghum_bicolor mirnest 100 100 -59.929 ....(((((.(((.(((.(((((((((((((...................)).(((.(((((((((...((((((((.................................))))..))))....))))))))).))).......((((((...((................................)).)))))).((.......))..))))))))))).))).)))....))))) (-59.929)