mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGATCGGGAC CCCGCCTTGCACCAAGTGAAT CCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCTGCCGCCGTGCTCGGACGGGACAGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCCGAGCCG CATTCACCAGGCAGCGAGCGGGGAGAGCGGGGCAGCGGCGGGCCGCGGGCGCCGTGCCTGCCACGCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCTGCATCCAATCCACGCCACACGAGCGACCGAGCAGGGCGAGGAAGGGAAGATGTCAAGCGCCCCAAGCCGCCGCGCCGCCTCGGGCTCGCTTGGTGCAGATCGGGACCTGCCGCCGTGCTCGGACGGGACAGATCCCGCCTTGCACCAAGTGAATCCGAGCCGGAGCAGCCGACCGACCGACCGCCGCCGCCTGCGCTGCTCTGCTCTGCTCTTGATTGCGATGCCGTAGCCTGCTTGCTGCGTGTTTTTTTTTAATTTTTCTGATAAGGATCGTGCGGATTGCTGTAATGATTCTGTGTCGCCATGCGGATTGCTGTGATGATTCTGTGTCGCCGTGGGAATTATTGCCAGCCATACGGCGACCGACCGCCGCCGCCTGCGCTGCTCTGCTCTTGATTGCGATGCCATGGTGTTTTTATTTTTTCTGATAAGGATCGTGCGGATTGCTGTCGTCCTGTGTCGGCGCGCGGATTGCTGTCCTTCTGTGTCGCCGTTTGGAATTATTTGGCGCCGTGCGGATCTCTGCTCTCGATTAAGCAATCCGGATCTGGATCTGACGCGTAATTTCGGTAGTTTGATCTG 3 0 5' arm Sorghum_bicolor mirnest MIR168 1e-43 sbi-MIR168 7e-45 -46.4 .((.((((((.(((((((((((((..(((((.(((((((((....))).)))..))).)))))..))))))))))))).)))))).)) (-46.4)