mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTTAAAAGATTCGTCTCGCA CGAGACGTATCTTTTAAACCT TTGGCAAAATGAATACCGTAGCACTTTCGTTTATATTTGACAAATATTGTTCCAATCATGGTCTATATAGGCTTAAAAGATTCGTCTCGCAAATTACCGGGAACTGTGTAATTAGTTATTTTTTATCTATATTTAATGCTCTATGCATATCCCGCAAGATTCGATGTGATGGGTAATTAAAAAATTGCAAAAGTTTTTGGGAGCTAAACAAGGTCTTAGTTCTCAAAAATTTTCTTTTCGTCTCGTCACATCGAATCTTTGGACGCATATATGAGCATTAATTATAGATAAAAAAAATAGGTAATTACATAATTTACATATAATTTACGAGACGTATCTTTTAAACCTAATTAGTCCACAGTTGAACACTACTTGCCAAATAAAATAAAAATGTTAGAGTAGCTAAATCCAAAAA GTTTAGTTTTAAAATTTTTGGCAAAATGAATACCGTAGCACTTTCGTTTATATTTGACAAATATTGTTCCAATCATGGTCTATATAGGCTTAAAAGATTCGTCTCGCAAATTACCGGGAACTGTGTAATTAGTTATTTTTTATCTATATTTAATGCTCTATGCATATCCCGCAAGATTCGATGTGATGGGTAATTAAAAAATTGCAAAAGTTTTTGGGAGCTAAACAAGGTCTTAGTTCTCAAAAATTTTCTTTTCGTCTCGTCACATCGAATCTTTGGACGCATATATGAGCATTAATTATAGATAAAAAAAATAGGTAATTACATAATTTACATATAATTTACGAGACGTATCTTTTAAACCTAATTAGTCCACAGTTGAACACTACTTGCCAAATAAAATAAAAATGTTAGAGTAGCTAAATCCAAAAAAATTCAAAAACTCAACAAGATCCCAATCAAGAGTTTGTCAGCATATCTC 3 0 5' arm Sorghum_bicolor mirnest 100 osa-MIR2124b 0.0000000004 -128 ((((.........(((..(((((.(((.((((.((((((.(((.((.(((((.(((..(((.(((..((((.(((((((((.(((((((.((((((....(((.((((((((((.((((((((((((((((.((((((((((((((...(((...((((((((((((((((((..((.((((.......((((((((((((((((((........)))))))))))))))))).)))).)))))))))))))))))))).))).)))))...))))))))).))))))))..)))))))).)))))))))).))).....)))))).))))))).))))))))).))))..))).)))..)))))))).)).))).)))))))))).))).)))))..))).......))))... (-128)