mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
AAAGTTAGATAAGTTTGACTT GTCAAACCTCTCTAACTTTTA CCAAGTTATAGTTTACTACTTCACTTTAGCTTTGTCCCAAGTCAAACCTCTCTAACTTTTATCAAGTTTATAGAAAAATGCACCAACATCTAGAATATCAAACTAGTTCCATTAAATTCTCCATGAAATATATTTTGATAATGCATTTATTGAACTTGTAGATGATAATATATTATTTTCTAAAAAATTGATCAAAGTTAGATAAGTTTGACTTAGGACAAAGCTAATGTGAACAATAGTTTGAAACGGCG GCACGAGGAGAAAGTGTATTGTATAACAAATGTCAATGCTGCTTTCTCCATCCCTGTTGATATTGAGGCAATCAAAGGTTTTTCCAGCAACTTTAAGAACACAACTACCTTTGTGCTATTGTGAAATGTTTGGGAGGGGATACTGAAAAATTAACTCTTTCCTTGATTTTTTTAAGCACACTGGGCAAAGTCAATCTGAACAATTTGCCCTTAAATGGTACCATAGACCATCAATTCAATGTTTCTTTTTTTTGAAGAAATTCAGATTCATACATTCTTAATTAACTAACTACTCTCTGTTCCAAGTTATAGTTTACTACTTCACTTTAGCTTTGTCCCAAGTCAAACCTCTCTAACTTTTATCAAGTTTATAGAAAAATGCACCAACATCTAGAATATCAAACTAGTTCCATTAAATTCTCCATGAAATATATTTTGATAATGCATTTATTGAACTTGTAGATGATAATATATTATTTTCTAAAAAATTGATCAAAGTTAGATAAGTTTGACTTAGGACAAAGCTAATGTGAACAATAGTTTGAAACGGCGGGAGTACCTTTTATCTTTCTGCAATTTATTTCCAATTA 3 0 3' arm Sorghum_bicolor mirnest  100 ssp-MIR437a 1e-82 -65.5 ..........((((((((.(((((.((((((((((((.(((((((((...(((((((((.(((((.(((.((((((((((......((((((.(((((((((.((.(((...............)))...)).)))))))...............)).))))))......)))..))))))).))).))))).)))))))))...))))))))).)))))))))))).)))))...))))...)))).... (-65.5)