mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACAATGGAGTGAGGTGCAACG TTGCACCTTGCTCCATTGTGG GGCCTTGTTTACTTGGGTAAATTTCACTCTGTCCCCTGCAGTTCAGCATGGTTTTGCTTTGCCACTGCGATGTTCATTTCCATTGCACCTTGCTCCATTGTGGTATTGATGTTCTGCAGAAGCGAGTCCCTGTATCAAATAACTGTTGCAAGGTTGTTGGCATCGTCCATTGCCACACATGATACTATGCCACTAGCAGTCGTCAGCTTCAACTGTGTGTTGTCGTATTGCATACACGGGTAGTAGGTGCATCAGCATTATAGCAGTTATTTGATACAGGAACTCTCCACTGTAGAAGTACAAACCCACAATGGAGTGAGGTGCAACGCAATGAACAATATGGTAGCAGAGTGAAAGTCTGTGGAATTGCCGGGGGCAAAGTGAAATTTATCCGACTATTTATTTGT CTGCTGGAAATTTGAGTTTTGACATGCAGTGCAAACATTGTGAAAAGGAGTCAATAAATAGCTCTCTGTTGAACTTGTTAACATACCCATGGATAGAGAAGAGGGTGAATGAAGGTACTTTGAATCTTCATGGAGGCTACTACAACTTTATTGATTGCACATTTGAGAAATGGACATTATTGTACCGTGAAGGTTTGGAAGGTGGAAGCAAGTATGCTATAAAGAATAGGTCCACCTGGTCTTGACCAATGAAGGCCTTGTTTACTTGGGTAAATTTCACTCTGTCCCCTGCAGTTCAGCATGGTTTTGCTTTGCCACTGCGATGTTCATTTCCATTGCACCTTGCTCCATTGTGGTATTGATGTTCTGCAGAAGCGAGTCCCTGTATCAAATAACTGTTGCAAGGTTGTTGGCATCGTCCATTGCCACACATGATACTATGCCACTAGCAGTCGTCAGCTTCAACTGTGTGTTGTCGTATTGCATACACGGGTAGTAGGTGCATCAGCATTATAGCAGTTATTTGATACAGGAACTCTCCACTGTAGAAGTACAAACCCACAATGGAGTGAGGTGCAACGCAATGAACAATATGGTAGCAGAGTGAAAGTCTGTGGAATTGCCGGGGGCAAAGTGAAATTTATCCGACTATTTATTTGTGTGTTGTTTTCCGGTTGAAACCGTTGAGAAAATACGAATAAGCTGCAGGATCAGTCATAGTGCATGTAATTGTCGCCACATTTGGCGTTACCTTGTTATTGTAACATGTGTACCATTTGTTGTATCATTATAACTGTGAAATACAAATATTATACGGCCTCGTCAAATTTGCTTGTTGACAGTGTTGTTCGTTCAAAAGAGTCGGCAATGGAAACTCTGATATTCTACATGTTCCAACTT 2 0 3' arm Sorghum_bicolor mirnest 100 osa-MIR1875 0.00000000002 -162.1 .....((..((.((((((((((((((((.(((((((.(((((((.(((.(((((((((((((.((((...((((((((....(((((((((((((((((((((..(((...((((((((....((((.((((((((((((((((((((.((.((((...(((((....((((((.....((((((.(((.(((..(((((...........)))))))).))).))))))........)))))).)))))..)))).)).)))))))))))))))))))).))))....))))))))...)))..)))))))))))))))))))))...))))))))...)))).))))))))))).))))).))))))).))))))).)))))))))))))))).))..))..... (-162.1)