mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGGCTGGCTCGAGG TGTTGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTTCACAAAATGAAGGTTCTCACTCACTCACTCATCATATTTTGGGAGATGAAGTAGTAGAACTATTAAGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAATA ATGTGTTTGTTGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTTCACAAAATGAAGGTTCTCACTCACTCACTCATCATATTTTGGGAGATGAAGTAGTAGAACTATTAAGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAATATCTTTTATATGCTCTTCTTCTTATTCATTGTGGTTTGCTTCTTCTTATTATGCAAAGGTTTTCGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATATAAGCCGTTATCATTTAGATATTTTCGTGATAACGACTTCAGTGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCACCCAACATTTTGCTTCTTATATATTTATGAAGAACAACACTTCATGATGATGATATATAACTCTTCATCTACATTAATATTGTTGATATATAATACCACAAGATAAGAGAAAGCTAGGTAAGTCTTTGACTTTACATCAGTTCCATTTTCCAGTTAACGAGAGAAGCAGTGACAGTG 2 2 3' arm Arachis_duranensis mirnest mir-166 3.0E-11 ptc-MIR166f 5.0E-13 -50.2 .....((((((((((((..((((((.(((((((((((((.....))).((((((.(((.((((((((.(((.....)))))).)).))))))))))))...)))))))))).))).))).)))))))))))).... (-50.2)