mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGGTATCAGGTGTCAGGTAT CTTGCGCCTAGACCAGAC GCATTGTGTTGAGCTTGCGCCTAGACCAGACGACCACTCAGGACGGTGTAAGAAGGCTAGCGCGATCAGGTATCAGGTGTCAGGTATCAGGTGTGGG TGCGGAACGCGTTTGTCGTCGCCTCTGTGCACGGCGTTGTATGCGGTAGCACAATTTTGAATTTCTGGAGTAAGTGCTACTGCCCATGCGAAATTCACCAGGAGACCGAGGACCTGGACCTGCCAGAGGCAACCGCCCACGCGGGCGTGCTCGCTGTGCTGGAGGGCAAAACGCACGCGGCGTATTACCTGCTGGAGCAGTCGGGGGAGGTCGTGGCGCAGCTGATGATCACACTGGAATGGAGCGATTGGTACGTGTTGGGGTTGCGGGTAAGGTGCGGGAGGGGGCAGGGTGTGTGGCGGGAGTGCTGCAAGATACAGTGCCCTCCACGGGTGCGACATGCCCCCACGGCCATAGGGCCATCCGTGGCTCTCGCCAACGCGGCGTCCCCACACGCCGAAGCATTGTGTTGAGCTTGCGCCTAGACCAGACGACCACTCAGGACGGTGTAAGAAGGCTAGCGCGATCAGGTATCAGGTGTCAGGTATCAGGTGTGGGCCGCAGGGCGGTCGCGGTAAGCCTGCGCTCCGGTGCTTGCGTTTGGGGCAGGCTCCAACCTCTTTTGCAACCTGTGCGCATGCATGGACACCGGTGCCAGGCCGGTAAAGGTGGCGAGAGGTACCGGTTGTCAATGACACACAAACTTGCGGGTGTNCACACGTNCGCTAGCAACAGACTCGGCAAACCACGCCCGTCGTTTTACCGACA 4 2 3' arm Chlamydomonas_reinhardtii mirnest SSU_rRNA_bacteria 0.0003 100 -23.6 (((...)))....(((((((((..(((.(((.((((((...((..((((.((....)).))))..)).)))....)))))).)))...))))))))) (-23.6)