mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCCTAT GGGGATGAGGATGATGTGG TCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCCTATCTTTATCCACTCACAACGCAAGAGGAAGACAACCCCTACAGCTTCTATTTTTCTACAAATTCACCATCAGATGATGTTGAAATCATCTCCACCCTCATGCGTACGTCATATCCACAACAATTCATCATCCCTTCTCAATCACGACACCTTTTTACCGTTAGCATTCGCAACCGCTACGGCTACGAATCAGATGAAGATGAATAACGTTTTCAATGCATTTGAAGTGTAGGTGGAGCTTGATAATCCGGAGAACTAGAAGTTTCCAAATGGATATGGGGATGCTGAAATTTGCCATTGACTGTGAACGGATAGATGATGGGGATGAGGATGATGTGGGAGTGTAAACGTGATGGC GCGGGAAACCTAATTTTCACCATTTTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCCTATCTTTATCCACTCACAACGCAAGAGGAAGACAACCCCTACAGCTTCTATTTTTCTACAAATTCACCATCAGATGATGTTGAAATCATCTCCACCCTCATGCGTACGTCATATCCACAACAATTCATCATCCCTTCTCAATCACGACACCTTTTTACCGTTAGCATTCGCAACCGCTACGGCTACGAATCAGATGAAGATGAATAACGTTTTCAATGCATTTGAAGTGTAGGTGGAGCTTGATAATCCGGAGAACTAGAAGTTTCCAAATGGATATGGGGATGCTGAAATTTGCCATTGACTGTGAACGGATAGATGATGGGGATGAGGATGATGTGGGAGTGTAAACGTGATGGCGCTTGCTTGACAAGAGGATGATGGCATTACTATCCGACCAGGGTCAAGGTACAAATACTACACCAAGACCTTTGTCTATAAAGACTAAGACTGACTCTAACAAAAACTCATTAACATTCGCAGTTGTGGCTAAGACAGATATTATGATACTGAAACCTAGATCATGTGTATGGGTGACGGAGTCGAATACGAAATCATTAATAACATTATCTTGTAAAGGTCATGTACAGAACGATGAATAACGAGACCGAGAGACAGGGTCAAAGTCAACTAAGAATCCGATCAAACTTTCCTACGTAGGACAGGGTCCCACCGAAACAGAATCTGAATCATCGAACATGAAGAACACTCACGCTACCGATACCTCTGATAAGGACGATACACCGGCACGGTCTTTACCCATACTACAACTATGTA 2 2 5' arm Helianthus_ciliaris mirnest 100 100 -96.2 ...(((((((...(((..(((.(((((((.(((((..(((((((((((((..(((((..(((((....((.((.((((...((((((((.((((((.....((((.((((....)))).))))((((.(((((((..(((((((..((..........)).(((((((.((...(((.......((....(((.((((((.(((..........))))))).)).)))))))).)).))))))).)))).(((((.....))))))))..)))))))..)))).....)))))).))))))))(((....)))...)))).))))....))))).......)))))..))))))).))))))))))).))))))))))..))).....))))))). (-96.2)