mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTTGTGGAACTGAAGTTGAT CTTTTTAACAGTACTACAAGTAA ACTCAAAGTTCGTTTGTGGAACTGAAGTTGATCTATAAAATCTTTTTAACAGTACTACAAGTAAACATCGAT TTTTTTTTTTTTTTTTAAATACAAAACGCTTTATTTATACTACAATACTTTAACTGGAACTTTATCGTTCAATAATATCGTCTTTACTTTACTCGTTTATTAAAGTATCAACACAACGAAAGTATCTACCAGGTATGACAATAGACACATTCGAGGTCGCGGTTTTTACAGCATGTTACGATAGAACATTTAATTCATGAACCACTCAAAGTTCGTTTGTGGAACTGAAGTTGATCTATAAAATCTTTTTAACAGTACTACAAGTAAACATCGATCAATATAAAAATAGCAATACACTTTGATTCATACATTATGTCCATTATTTAGACGGTCGTTGCTCGATTTTATGCATTCACAGCATCCATGACTGACTGTAATGCTGCACAAAGTTGAAATTTCATTAAAAACGTAGGGCAATTTCGCAACGCAGATCGGGACGAAATTAACGGCCAAAATATACTACTGCTTCTCTTATAAAGCTTTGTGCTCGCGATCTAGGGCTGTATATAGAAATGTTATCTAAAGGCCTGGCTAAACTAAATGTGTCCAAGTTTAGCAACCACCAAAAACATCAAATGCGCGACAAATTTTGCAGAGCGCAACACGAAAATGTTTCTCAACCATCCGAGAAACATTTCTTTGTCGCGGCTACAAGACTTGGCGCGCGCTACAATGATTTCCGAGGTGACTAAACTAGGAGACATGTCACACGCTACATGTGTCCTAGTTTAGCCAGGCCTTAATGATAATCAAATACAATATGCGCGGTTGATCAGGAACGTCAACTTAACTGAATTGAAGGGGTCTAGATTTAAAGGTAAACATAAAAAAATCATA 3 2 5' arm Nematostella_vectensis mirnest 100 100 -12.7 .......(((.((((((((.(((((((..(((.......)))..)))..)))).)))))))).)))...... (-12.7)