mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAATAAAAATAATAATAACA TGCATTATATATTTTTAATAGCT TTCTTTCTTTTTTTTTCTTTAATAATAAAAATAATAATAACAATAAAGTCCTGTCCCGTTTTAAGTGTTTTAACCCCCGATCACTGCTACCCTTTCCGATTGATCTGAGCCCCATAACGCTTGTCAAGGCTCTGCCTGACTAAAGTTTATTAGGGTTTTGTCTCGTGACATAGGGGCAATGTTGAATTAGGGGTAGTAAACGAGTGCATTATATATTTTTAATAGCTTAGAAGTTATATCCAAGA TTTTTCCTTCTTTATCTCTCGTCACATCTCTGTATATTCTTTCTTTTTTTTTCTTTAATAATAAAAATAATAATAACAATAAAGTCCTGTCCCGTTTTAAGTGTTTTAACCCCCGATCACTGCTACCCTTTCCGATTGATCTGAGCCCCATAACGCTTGTCAAGGCTCTGCCTGACTAAAGTTTATTAGGGTTTTGTCTCGTGACATAGGGGCAATGTTGAATTAGGGGTAGTAAACGAGTGCATTATATATTTTTAATAGCTTAGAAGTTATATCCAAGATTTATACCAGGAGGCTTTCTAGTTAAACCCTAAAGTTACAAATTGAGTACATTCTCTTTTCTTACTGTTTTATTCCCTTTTTGTGATTCACCCAAAACTATTATTTATTATTTTATTTTGTCAAATAAGAAACCCTATTTGAGACTCCCAAGTAATCCTGCATAAACCCTAAAATTTTCAGAACAATCAGAATCAGGATCAGGGCCCTTAAAACTTAGGGGGTATTTCCTAGTCAATATTATCTAAACAGTTTGTTGTCAAAATCAAATTTTAACGAACGATCGACTCAGCTAGGCTACCAAGACACGGGGCTACCCTATGCTAGGGTGGTGCCCCTCGCGCCACGCGAGTGAGCTGTTTTTCCAGTATAAATAGAGGGGTGTGGGACTTAGATTTCTGCCGTGCCGCGAGATATCATCTGTTTACTACTAAAACACACACAACACGAAGTTCTGCCGCGAAAATAGGGTAATAACTTGATCGCTATTACGATTCAATATA 4 2 5' arm Helianthus_exilis mirnest 100 100 -45.5 .((((........(((((....((.(((((((((((((.((..(((((..........)))))..(((((..(((((.(((((.(((..((((.(((((..(((..((((((...(((....((((.(((...)))))))....))).....)))))).)))))).))...))))))).))....))).)))))...))))).))..))))).)))))))).))....)))))........)))) (-45.5)