mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTGTGTATGTGCATGTGTGT ACACAGCTCTTGCGCACACT CGCGCGAAGAGAGTGTGTATGTGCATGTGTGTGTGTTAATCGAATATTTTAACTCATCAAAAATCCCGTAGCGGCCCCTCCCCTGCGTATAGTAGTGTTAAATAAAAAATAGTGTAACCGTTAATTGTAGCCTTTTCCTTAGCGTTCTCGTGAAATTTAGAGCCCGAATTTATACACACAGCTCTTGCGCACACTTCACCACT GCCACCATCACCGATGGTGGATGATTGCTTACTCCTGTTTGTCGAGAGCCCATGCTTATGTCCAGTGAAATGTTTATTTCTTTCCTTTTTTTAATGATTCCTTTTAATTTGTCAACGATTTGAGCTTTTCTTCTGCTGCCAGTGGATACACCCTGGTGTCTGCTTTAAAATGGTTTTTTCAATTCAAAATTAGAGCTTATACATACACCCAGAGCTTTTTAGCGATACAACAGATAACAGACAGCTAAGCATAAGGCCGTTGTTGTTGCGTTCTTGTTTTGTTTTTTGTCATTTCCTTCTTTTTCCCCCTTTTCAAGCTCTCTAGCCTTGCGTGCGCGTGCGCGCGCGCGTTCTTTTGCTTTTTTTCGAGATAGCTTTCAACTCGCTTATATGCACATTGAACGTTTATTGATTAATTAGTAGGAAATGGAATGAAATGTTTAATAACAACAACAGCAACAACAAAGAACTATAATTCGAACGTAGCAGGGGATGGCAGTGAAAAGATAAAAATGGAATTAATTTATGTGGCTACTCTAACAGGGCGCGCGAAGAGAGTGTGTATGTGCATGTGTGTGTGTTAATCGAATATTTTAACTCATCAAAAATCCCGTAGCGGCCCCTCCCCTGCGTATAGTAGTGTTAAATAAAAAATAGTGTAACCGTTAATTGTAGCCTTTTCCTTAGCGTTCTCGTGAAATTTAGAGCCCGAATTTATACACACAGCTCTTGCGCACACTTCACCACTCCATCATACACAACAAAACACGGAAAGGCGAAATTTTGCTCTCGCTAGCAGCAAACCTTCAAAACAACGTTTCCTTTTGCCGTTGCGCAGCGTTGGACGAAA 4 1 5' arm Anopheles_gambiae mirnest 100 100 -32.6 .....((((...(((((((...((.((((((((((....(((.....((((((.............(((((.((.....)).))))).........))))))(((..((.((.((.((........)).)))).))..)))..(((((..........))))).)))...))))))))))))...))))))).))))...... (-32.6)