mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAATAATAATAATAATGATG TCATTATCTTTAATTTCTTATTT CCCAACATACCTACACTCATATGTATCATCATCTATAACCTCAACCAGATCATCATTATCTTTAATTTCTTATTTCACACAAACAAACTTTATGTAAAAACCAATCTAGGGTTTCAAACCGTTGCATACTGATTTGAAATTTTCGTAATTTATAAATTTCGAATCGTATATTAAACGAAACAAATAGTGATGATGAACGGGGGAGGATTCCGGTCAGGTAATACGACGTCGTCTTCGGTGTGTAATATGAGCGAGATCTGGCGGTATCCGGTGAGTCATGGGAATGGCAATGCGGCGTCGTTTGGCATGGGGGATAATAATAATAATAATGATGGTGGTGTGTTTATGGATGATGATCCGATGGTGGTGAGTAAGAAGCGGCG TCCCGAATCCTCTTTAGAAGTCACTTCTCTCCACTCTCCAGGTCTACCTTGCTATTGTACGCCGGTCGTTGGTACACTGCGCACCCCAACATACCTACACTCATATGTATCATCATCTATAACCTCAACCAGATCATCATTATCTTTAATTTCTTATTTCACACAAACAAACTTTATGTAAAAACCAATCTAGGGTTTCAAACCGTTGCATACTGATTTGAAATTTTCGTAATTTATAAATTTCGAATCGTATATTAAACGAAACAAATAGTGATGATGAACGGGGGAGGATTCCGGTCAGGTAATACGACGTCGTCTTCGGTGTGTAATATGAGCGAGATCTGGCGGTATCCGGTGAGTCATGGGAATGGCAATGCGGCGTCGTTTGGCATGGGGGATAATAATAATAATAATGATGGTGGTGTGTTTATGGATGATGATCCGATGGTGGTGAGTAAGAAGCGGCGTGAAGATGATGATTTGTCGACTAGCAGCCGGAGTAATAATACAATGCTTGACGGTGATGGCAAACGCTTGAAGACTTTGGCGCTTGAAAACGAGAACTCGGAAATTAAACCAGAAGATGAAAGAAGTACCGGCAAGATAGCGGAAAACAGTGCGAAACCGACTGAACCGCCTAAACAAGATTACATTCACGTTCGCGCAAGAAGAGGTCAAGCCACTGATAGCCACAGTCTAGC 3 2 3' arm Helianthus_exilis mirnest 100 100 -85.6 .......(((.(((..((((..(.((((((((((((((...((((((..((((((((((..(((..((.(((((((...((..((.(((...(((..(((((.......))))).....((((..((((.((((((((((((...........))))))))))))))))....))))..)))...)))..)).(((.(((((.....))))).))).((...(((((((((((.((((..(((.....((......))..)))....)))).).(((((....)))))...))))))))))...)).)).))))))).)))))..)))))))))))))).)).)))))))))))))).).))))..))).))).......... (-85.6)