mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTGATTTCGAATGGTGCTAG AAGCACCGATAGGAAGCCAGTGC CTTCGTCGGGTACTGATTTCGAATGGTGCTAGAACGATTTCATATGCCATCTAAGCACCGATAGGAAGCCAGTGCCCGTCAGG CGAGGCCAGATTCGGCACGAGGAGTGTNATAATGTGTGTGTGTGTATAATTTACTAAGGACCACATGTATTCCCTCAATATCCGGCCCCCGACGTGCTTTGCTTTGCTCTGTCTGATTGTTATTTAAGTTTAGTTGTTCACGTTGTCGTTCCTTCGTCGGGTACTGATTTCGAATGGTGCTAGAACGATTTCATATGCCATCTAAGCACCGATAGGAAGCCAGTGCCCGTCAGGATTATGCCCCTGCCCCGCTATACGCCCGCTAGGGAATGTTGCTAGCCAGAAGTGCATCCCCAAGAGAGGAACATGAATGTAACTTCAAAGTGCACTTGTTGATGATGTATAGTATGCAAGTACAGATTTGTTCTATAAGAACGCACACACACACATACACTCGCAGAAGTATGTCTAACGGGAAGGAGTTTTAATAGCACCGAACACACACACACGCACACACAAACACATACACTTATTTTTTAATTTGTAATGTTTAAGCGAAGGAGAAGCTAGATGTTTGTTTTAATCGAGAAAAAAACTCAATCCCCTCCAGAGAAAAGCAATGAAATTGAAAAAAAAAATCAAAATTTTTATACGAGTTCCACACACACAACGGCACACACGTGTTCGTGGTGGAACAAAGCGGCAAATGCAAACGGAAATGTTTTTTTTTTTTTAAACTATATTTAGCCATGTAAGTCAAACTGAAATCAAACTATGTAACGTTATGAAATTATTAAGCCCATTTACGAGCGCAGATGTTTGTGTTTAGAGACTGCTAGGAGATGATCTAGGATCTAGGCGAGCAGGGAAGGCTCTCTCGATCGAGCAGTAAAGGAGAGGCAAACGCTAAACACGATGATACATATTTTGNGATAAA 4 2 5' arm Anopheles_gambiae mirnest 100 cqu-mir-285 4.0E-9 -27 ..((..(((((((((.((((...((((((((((................))).)))))))...))))..)))))))))...)) (-27)