mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAGGTACCTGAAGTAGCGC GCTGCGACAGGTGCTTCCGGCT TATTACTACTGGCCACTCCCCGTGCTGCGACAGGTGCTTCCGGCTGTGTTAATAACTGCGAGTCAGGTACCTGAAGTAGCGCGCGGAGTGGCTCGGAACGAT TAACAACCATTTCACATTATTACTACTGGCCACTCCCCGTGCTGCGACAGGTGCTTCCGGCTGTGTTAATAACTGCGAGTCAGGTACCTGAAGTAGCGCGCGGAGTGGCTCGGAACGATCTCCATTTTACTGGTGCTGCCGCCGCCACCGACATCCATTCGCTCCCTCCCCCTCAATTTTTCGTTATGTGAATTCCCGACCGTCTCTATTGGCCTCATTTTTACTCGTCATCGATCCAGGATGTCAGAAAATGCCAGATCACCTTTAATCTGATGATGTTGCAACTATTTATTTTTATACTTTTTCGGCCTCTCTCGTCTGGTGGATTACGTAACTCGAGATTTTTGTTTTTCCCGATTCGCTCCAAAGTGAAAATTTGTGTGCGTTCGCGTGTGCCATTTCTTAATTTGACAATCGACACGCCCAAGAGAGAAA 2 2 3' arm Daphnia_pulex mirnest mir-275 0.00000009 dpu-mir-275 3e-47 -44.8 ........(((((((((((.((((((((..(((((((((..((((.(((........))))))))))))))))..)))))))).)))))))).)))...... (-44.8)