mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGCACTGGAAGAATTCAC GGGTTCCCTGGTGCCAGAG TTCCGGTGATCCTTGGCACTGGAAGAATTCACAGAGTGCATTACGACAGGTCGTGGGTTCCCTGGTGCCAGAGATTGCTCCC ATCCTCTGCTTATCTTTCATTTCATTTGAATTGAATTACTCAACATTATTGAGAGACTATGTAGGAAATTAAATATTCCGGTGATCCTTGGCACTGGAAGAATTCACAGAGTGCATTACGACAGGTCGTGGGTTCCCTGGTGCCAGAGATTGCTCCCGGAAATCAATATCATCACAATTACATTTATGCTAGGAATTGATTTATCGATTTATTGCCCATGCTGCCTATTTCTGTGTCTATACACAAATGTCGCGTCTGTAATAAACTTTGGAATCGCCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCT 1 1 5' arm Daphnia_pulex mirnest mir-263 0.000004 dpu-mir-263b 5e-36 -28.3 ....(((((((.((((((((((..((((((((....................)))))))).)))))))))).)))))))... (-28.3)