mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGCTGTTTTAAAAAAAA TTTCTTAAAAAATAAAATCAAA CCCTAATTCATTGATTGCTGTTTTAAAAAAAAAATGTTAAAATAATAATCCATCCCTTTTTTTTTCTTAAAAAATAAAATCAAATGTAAAAA CGCCGCGCGGCCCCNTCGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTAAATAGCCAATAAATATTTTATTCAAAATAACACAATATTATCAATTTTACATAACACAAATTTTCAAAGCCATATAATTATGGGTTAAAACTAACACAATAAGTATTTCAATAAAAAAACTAAAATAAAACATTTTAACTCCATAAATTACATTAAAAAATATATTTTTACAAAAATTTACGGCGATAGGGTTTAACATTTCCCCTAATTCATTGATTGCTGTTTTAAAAAAAAAATGTTAAAATAATAATCCATCCCTTTTTTTTTCTTAAAAAATAAAATCAAATGTAAAAAATTATAAAAATTAATTGGTTTTAAATTCATCTATAAAAGTTCAAACTAA 5 1 5' arm Nasonia_vitripennis mirnest 100 100 -9.7 ..........((((((....((((((.(((((((........................))))))).)))))).....))))))......... (-9.7)