mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATGTTGGCTGGCTCGAGG TCGGACCAGGCTTCATTCCCC TTGTTGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTTCACAAAATGAAGGTTCTCACTCACTCACTCATCATATTTTGGGAGATGAAGTAGTAGAACTATTAAGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAATAT ATGTGTTTGTTGTTGAGGGGAATGTTGGCTGGCTCGAGGCTTTTCACAAAATGAAGGTTCTCACTCACTCACTCATCATATTTTGGGAGATGAAGTAGTAGAACTATTAAGGCTTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAATATCTTTTATATGCTCTTCTTCTTATTCATTGTGGTTTGCTTCTTCTTATTATGCAAAGGTTTTCGGTTGAGAGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTCATATAAGCCGTTATCATTTAGATATTTTCGTGATAACGACTTCAGTGATTCTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCACCCAACATTTTGCTTCTTATATATTTATGAAGAACAACACTTCATGATGATGATATATAACTCTTCATCTACATTAATATTGTTGATATATAATACCACAAGATAAGAGAAAGCTAGGTAAGTCTTTGACTTTACATCAGTTCCATTTTCCAGTTAACGAGAGAAGCAGTGACAGTG 2 2 5' arm Arachis_duranensis mirnest mir-166 0.00000000003 ptc-MIR166f 0.0000000000005 -50.2 ......((((((((((((..((((((.(((((((((((((.....))).((((((.(((.((((((((.(((.....)))))).)).))))))))))))...)))))))))).))).))).))))))))))))..... (-50.2)