mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGAATGGTTTAGTGAGATC TCAAACTTGATCATTTAGAGG CGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCCTCGGCGTCGGGACGGCTTTGCCGCCTCGCTCGCATGTACGAGAAGACGATCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAA ACGTCTGAGTCGGTCGGATTCCGGGTCGACCCACGCGTCCGGGGATAGGGAGTTGCAATTATCTCCTTTGAAGGAGGAATTCCCAGTAAGCGCGAGTCATCAGCTCCCCTTAATAACGTCCCTGCCCTTTGTACACACCGCCCGTCGCTACTACCGATTGAATGGTTTAGTGAGATCCTCGGATCCTCGGCGTCGGGACGGCTTTGCCGCCTCGCTCGCATGTACGAGAAGACGATCAAACTTGATCATTTAGAGGAAGTAAAAGTCGTAACAAGGTTTCCGTAGGTGAACCTGCGGAAGGATCATTACCGAGAAACTTCTCTGTTTTTGGCCAGCCCAAATTCAAAGAACAACTCCCACTTTGCCAGGCCCTTCCTCTCCCGAGAGGGATTGGCGGGGTCCGACAGACACCCGTGCACAACTCGACCCGTGAACTTGGGGAGAGCCATCCGGGCGGTGCCTGCCGCGGCGTTTCGGCGTCGCGACGAGCCCCCGGGCCCAGCGACCGGCGGTCTAACGACACCACCCCGGCATTCACACCGTCGGGGCGGTATCCCGCTGGGAGGGCTTGCAGCGAAGGTCCGGGAGAGTGCGGAGGCAGGGGAAACTTGGCCTCCGCGTCTTACACGCTCTCCCGGCGCTCCCCGCCNANNNNNANANNAAAAAAAAAAAAAANAAAAATTAAAAAAAATATAAAAATTATNTTNTTTTTATTTTTTATATAATAAAATNAAAAAAAAAAGGGGCCCCCTCTTAAGGAATCCAGCTTTCGATCGCGTGCTTGCAAAGTCTTAACTTCTTTATAAGGGCCCCTAAATTCAATTTCCTTGGCCGTCCTTTTTTAACTTCCGGGCGGGGGAAAACCTGGGGGATTCCCACTTTATACCCTTTGGAAACATCCCCCCTTTTTCCAATTGGTTTAATAACAAAAGGGCCGGCACTGATCCCCCTCCTAAATTTTGGCACCCCTGTAAGGTCAATGGGACCCCCCCTGACCTGCCTATTATCCCCATGGGGGGGGGGGTTGTTTCCCTTG 4 0 5' arm Strongylocentrotus_purpuratus mirnest SSU_rRNA_eukarya 2e-46 100 -36.8 ...((((.((..((((((((((.(((..((((.((...((..(((((.((((.((((...)))).))))..))).))...))...)).))))..))).)))))))))).)).))))... (-36.8)