mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCTCTCTCTTCTGTCAACG TTTACACAGATAGAAAGCGG AAACACGAAATCTGAAGAAACGTTTACACAGATAGAAAGCGGCTTTACTTTGAGCTTCCAGAGGGGCCATGGCCGCCCTGATGAGCAGGTGGTTGCTGGTAGCAGCCGCTCTCTCTCTCCGTATCAAACCTCTGGCGGGTTCCAACTTCCCAGCAAAGGTGTAGGAGAATACTCAGGAGGTCTCAATGAATCGCAAGATTTCTACAGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAACGTCTTCGGATTCACGTGGGA GTCCCGCGTGCCAAATTGATGGATGTGAGCTGGATCTCTCATCTGCTAAGGATTATCATCGCAAGCATAGAGTCTGCGATATCCATTCAAAGTCCCCGAAAGTTACTGTGGGTGGCTTGGAACGTCGGGTTCTGCCAACAGTGTAGCAGGCTGCATGCCGTCTCTGAATTTGATGAGAAGAAACGAAGCTGCCGCAAACGTCTTACGCATCATAACGCGAGGCGTCGCAAGCTGCCAGGAATGTTTCCATTGAATCCAGAGAGGGTTTGCGATCGAAGACAGCATACAAATATGTTGTGGGATGAGTTGTCTCTAAACACGAAATCTGAAGAAACGTTTACACAGATAGAAAGCGGCTTTACTTTGAGCTTCCAGAGGGGCCATGGCCGCCCTGATGAGCAGGTGGTTGCTGGTAGCAGCCGCTCTCTCTCTCCGTATCAAACCTCTGGCGGGTTCCAACTTCCCAGCAAAGGTGTAGGAGAATACTCAGGAGGTCTCAATGAATCGCAAGATTTCTACAGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAACGTCTTCGGATTCACGTGGGACCAAACACAATCCCATGGTCGAGTCACAGCCAATACATGGCACTTTCCCTACTCATTTTATGTAAATGCGTAAGGAATGCGTAAGTCACTCCTCCATGAGAAAGTCAGGTTGCATCCAGTGGAGTTTCTTTTCAAATAAAAATAAGAATGTGTAACGTTCATTGTTCAAGCTTAAACCCTGTACACTGTTAACTCCGGTTCCCTCTACATTTCCAAACTTATTTAAGTCAACTTCTTC 4 1 3' arm Brassica_oleracea mirnest 100 far-MIR156b 0.00005 -81.3 ...((((.((((((((((..((((.(((.(((.(((.((((.((.((..((((((((((.(((((((.......)))).((.(((..((((((((((...)))))))))))))))(((((.......((((((((.((((....)))).))))...))))...)))))...))).))))).))))).(((((....))))).)).)))))).))).)))..))).))))))))))))))..))))... (-81.3)