mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
CAGTAGTCTGCACATTGGTTA CCCAGTGTTCAGACTACCTGTT CTTCTCACCCCTCAACCCCCACCTCGCCTGCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCATCAGGCCGCAGCTGAGCAGTAGTCTGCACATTGGTTAGGCTAGGCTGGGAAATGACACCAAATC GGGGATTTCAGCCCGCCTGCCACGTCAGTTTGCCTCCACCATCGTACCGCTCCTTTCTCTTCGACTTTTCACAAAAGGCTACCAACTCTTTAGGTGGGCTTTTCCCCCCGCTTTTTAAAACAAAATCTTGGTGGAAGAATGGATACAACTGAGGACTAAGGGCGATCAATTGGAGCCTGCAGACGTAATGACCTCTGGGTCCTTCCTCCCATCGGAGTCCTTCTCACCCCTCAACCCCCACCTCGCCTGCCCAGTGTTCAGACTACCTGTTCATCAGGCCGCAGCTGAGCAGTAGTCTGCACATTGGTTAGGCTAGGCTGGGAAATGACACCAAATCCTCATTTGGGATAGTTTATATTAGCAGCAGTTTCTTAACTGCTGCAACTCTTCTCACCTCCTCATTTTTGTACCAGGACAGGGACTCAGCAGTCAGGACAAACCAGTATTCCTTGGAGCCTCCTTTCATGATGCTGATGTTGATGGTTAGCCAGCCTTTCCTGATCACCTATAT 2 1 3' arm Oreochromis_niloticus mirnest mir-199 7e-46 dre-mir-199-3 8e-30 -42.9 ...........(((...(((((((.(((((.(((((((.((((((((.(((((....(((....)))))))))))))))).))))))).))))).))).))))...)))......... (-42.9)